SARSコロナウイルス2
電子顕微鏡による写真 世界のCOVID-19発生地図
分類
レルム:リボウィリア Riboviria
界:オルトルナウイルス界 Orthornavirae
門:ピスウイルス門 Pisuviricota
綱:ピソニウイルス鋼 Pisoniviricetes
目:ニドウイルス目 Nidovirales
亜目:コルニドウイルス目 Cornidovirales
科:コロナウイルス科 Coronaviridae
亜科:オルトコロナウイルス亜科 Orthocoronavirinae
属:ベータコロナウイルス属 Betacoronavirus
亜属:サルベコウイルス亜属 Sarbecovirus
種:SARS関連コロナウイルス Severe acute respiratory syndrome?related coronavirus
株:SARSコロナウイルス2 [1] Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2
新型コロナウイルス感染症 (COVID-19) を引き起こすSARSコロナウイルス2 (SARS-CoV-2) は、他のウイルスと同じく突然変異率が高いため、時間の経過とともに多くの変異株が生じる。この項目では、注目すべきSARSコロナウイルス2の変異株(サーズコロナウイルスツーのへんいかぶ、英語: variants of SARS-CoV-2)について説明し、これらの変異株の一部または全てに見られる注目すべきミスセンス変異についても説明する。
GISAID Sクレード、PANGO(英語版) A系統、Nextstrain(英語版) 19Bクレードに属する「WIV04/2019」塩基配列は、「シーケンスゼロ」として知られる、ヒトに感染する原型ウイルスの塩基配列を最も厳密に反映している可能性が高いと考えられており、参照配列として使用される[2]。 この節は更新が必要とされています。
変異株対照表.mw-parser-output .ambox{border:1px solid #a2a9b1;border-left:10px solid #36c;background-color:#fbfbfb;box-sizing:border-box}.mw-parser-output .ambox+link+.ambox,.mw-parser-output .ambox+link+style+.ambox,.mw-parser-output .ambox+link+link+.ambox,.mw-parser-output .ambox+.mw-empty-elt+link+.ambox,.mw-parser-output .ambox+.mw-empty-elt+link+style+.ambox,.mw-parser-output .ambox+.mw-empty-elt+link+link+.ambox{margin-top:-1px}html body.mediawiki .mw-parser-output .ambox.mbox-small-left{margin:4px 1em 4px 0;overflow:hidden;width:238px;border-collapse:collapse;font-size:88%;line-height:1.25em}.mw-parser-output .ambox-speedy{border-left:10px solid #b32424;background-color:#fee7e6}.mw-parser-output .ambox-delete{border-left:10px solid #b32424}.mw-parser-output .ambox-content{border-left:10px solid #f28500}.mw-parser-output .ambox-style{border-left:10px solid #fc3}.mw-parser-output .ambox-move{border-left:10px solid #9932cc}.mw-parser-output .ambox-protection{border-left:10px solid #a2a9b1}.mw-parser-output .ambox .mbox-text{border:none;padding:0.25em 0.5em;width:100%;font-size:90%}.mw-parser-output .ambox .mbox-image{border:none;padding:2px 0 2px 0.5em;text-align:center}.mw-parser-output .ambox .mbox-imageright{border:none;padding:2px 0.5em 2px 0;text-align:center}.mw-parser-output .ambox .mbox-empty-cell{border:none;padding:0;width:1px}.mw-parser-output .ambox .mbox-image-div{width:52px}html.client-js body.skin-minerva .mw-parser-output .mbox-text-span{margin-left:23px!important}@media(min-width:720px){.mw-parser-output .ambox{margin:0 10%}}
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SARS-CoV-2の出現は、コウモリのSARS様コロナウイルスとセンザンコウコロナウイルスとの間の組換えの結果である可能性があるが(異種間伝播による)[3]、突然変異は進行中の進化と新しいSARS-CoV-2の変異株の出現に重要な役割を果たすことが示されている。
中華人民共和国(中国)で最初にサンプリングされ同定された変異株は、研究者により「3つの変異株」によって元のゲノムと異なるとみなされている[4][5]。したがって、SARS-CoV-2には多くの系統が存在する。
次の表はリスクが高い、または高い可能性がある変異株の情報とリスクレベルを示す。信頼区間は特に明記されていない限り、95%の信頼度を仮定している。現在の状況については後節「#WHOによる分類」も参照
最初の検出識別注目すべきミスセンス変異[note 1]臨床的変化のエビデンス [note 2]拡散Ref.
地域日付命名日 [note 3]WHO ラベル [note 4]PANGO 系統名他の系統名伝染性毒性抗原性
ナイジェリア000000002020-08-01-00002020年8月??B.1.1.207P681H???国家間[6][7]
イギリス000000002020-09-01-00002020年9月000000002020-12-01-00002020年12月AlphaB.1.1.7VOC-20DEC-01, 20I/501Y.V1N501Y, 69?70del, P681H~74 % 増加 (NERVTAG)~64 % (32?104 %) 以上の致死性 (BMJ)抗原活性が減少 (ECDC)世界規模[8][6][9][10][11][12][13][14][15][16]
デンマーク000000002020-10-01-00002020年10月???Cluster 5, ΔFVI-spike (SSI)Y453F, 69?70deltaHV??中和抗体に対する感受性が中程度に低下 (WHO)絶滅の様相[17][18][19]
南アフリカ000000002020-05-01-00002020年5月000000002020-12-01-00002020年12月BetaB.1.351501.V2, 20H/501Y.V2,
VOC-20DEC-02N501Y, K417N, E484K~50 % (20?113 %) 増加 (ECDC)?抗体により中和が減少 (ECDC)世界規模[8][6][20][21][9][22][23][24]