PRIAM_enzyme_specific_profiles
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PRIAM enzyme specific profiles(PRofils pour l'Identification Automatique du Metabolisme)は、ペプチド配列の中から酵素である可能性の高い領域を自動的に検出するための方法である。PRIAMでは、位置特異的マトリックスを用いて自動的にそれぞれの酵素のエントリーを作成する[1]
出典^ Claudel-Renard C, Chevalet C, Faraut T, Kahn D (November 2003). “Enzyme-specific profiles for genome annotation: PRIAM”. Nucleic Acids Res. 31 (22): 6633?9. doi:10.1093/nar/gkg847. PMC 275543. .mw-parser-output cite.citation{font-style:inherit;word-wrap:break-word}.mw-parser-output .citation q{quotes:"\"""\"""'""'"}.mw-parser-output .citation.cs-ja1 q,.mw-parser-output .citation.cs-ja2 q{quotes:"「""」""『""』"}.mw-parser-output .citation:target{background-color:rgba(0,127,255,0.133)}.mw-parser-output .id-lock-free a,.mw-parser-output .citation .cs1-lock-free a{background:url("//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/6/65/Lock-green.svg")right 0.1em center/9px no-repeat}.mw-parser-output .id-lock-limited a,.mw-parser-output .id-lock-registration a,.mw-parser-output .citation .cs1-lock-limited a,.mw-parser-output .citation .cs1-lock-registration a{background:url("//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/d/d6/Lock-gray-alt-2.svg")right 0.1em center/9px no-repeat}.mw-parser-output .id-lock-subscription a,.mw-parser-output .citation .cs1-lock-subscription a{background:url("//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/a/aa/Lock-red-alt-2.svg")right 0.1em center/9px no-repeat}.mw-parser-output .cs1-ws-icon a{background:url("//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/4/4c/Wikisource-logo.svg")right 0.1em center/12px no-repeat}.mw-parser-output .cs1-code{color:inherit;background:inherit;border:none;padding:inherit}.mw-parser-output .cs1-hidden-error{display:none;color:#d33}.mw-parser-output .cs1-visible-error{color:#d33}.mw-parser-output .cs1-maint{display:none;color:#3a3;margin-left:0.3em}.mw-parser-output .cs1-format{font-size:95%}.mw-parser-output .cs1-kern-left{padding-left:0.2em}.mw-parser-output .cs1-kern-right{padding-right:0.2em}.mw-parser-output .citation .mw-selflink{font-weight:inherit}PMID 14602924. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC275543/. 

外部リンク

Claudel-Renard C, Chevalet C, Faraut T, Kahn D. “ ⇒
PRIAM: Enzyme-specific profiles for metabolic pathway prediction”. On-line database. Rhone-Alpes Bioinformatics Center. 2009年7月19日閲覧。


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