MSH6

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2O8F, 2GFU, 2O8B, 2O8C, 2O8D, 2O8E


識別子
記号 ⇒MSH6, mutS homolog 6, GTBP, GTMBP, HNPCC5, HSAP, p160, MMRCS3, MSH-6
外部IDOMIM: 600678 MGI: ⇒1343961 HomoloGene: 149 GeneCards: MSH6

遺伝子の位置 (ヒト)

染色体2番染色体 (ヒト)[1]

バンドデータ無し開始点47,695,530 bp[1]
終点47,810,063 bp[1]

遺伝子の位置 (マウス)

染色体17番染色体 (マウス)[2]

バンドデータ無し開始点88,282,490 bp[2]
終点88,298,320 bp[2]

RNA発現パターン



⇒さらなる参照発現データ

遺伝子オントロジー
分子機能? ⇒ヌクレオチド結合
? ⇒DNA結合
? ⇒protein homodimerization activity
? ⇒mismatched DNA binding
? ⇒ADP binding
? ⇒クロマチン結合
? ⇒oxidized purine DNA binding
? ⇒methylated histone binding
? ⇒damaged DNA binding
? ⇒ATPアーゼ活性
? ⇒血漿タンパク結合
? ⇒single thymine insertion binding
? ⇒four-way junction DNA binding
? ⇒MutLalpha complex binding
? ⇒二本鎖DNA結合
? ⇒ATP binding
? ⇒magnesium ion binding
? ⇒single guanine insertion binding
? ⇒guanine/thymine mispair binding
? ⇒ATP-dependent activity, acting on DNA
? ⇒酵素結合

細胞の構成要素? ⇒ゴルジ体
? ⇒intracellular membrane-bounded organelle
? ⇒MutSalpha complex
? ⇒核質
? ⇒染色体
? ⇒細胞核
? ⇒細胞質基質
? ⇒mismatch repair complex

生物学的プロセス? ⇒determination of adult lifespan
? ⇒cellular response to DNA damage stimulus
? ⇒positive regulation of isotype switching
? ⇒intrinsic apoptotic signaling pathway
? ⇒maintenance of DNA repeat elements
? ⇒positive regulation of helicase activity
? ⇒somatic recombination of immunoglobulin gene segments
? ⇒negative regulation of DNA recombination
? ⇒DNAミスマッチ修復
? ⇒viral process
? ⇒DNA修復
? ⇒meiotic mismatch repair
? ⇒intrinsic apoptotic signaling pathway in response to DNA damage
? ⇒response to UV
? ⇒somatic hypermutation of immunoglobulin genes
? ⇒クラススイッチ
? ⇒pyrimidine dimer repair
? ⇒mitotic G2 DNA damage checkpoint signaling
? ⇒negative regulation of DNA endoreduplication
? ⇒interstrand cross-link repair
? ⇒replication fork arrest

出典: ⇒Amigo / QuickGO

オルソログ
種ヒトマウス
Entrez

2956

17688

Ensembl

⇒ENSG00000116062

⇒ENSMUSG00000005370

UniProt

⇒P52701

⇒P54276

RefSeq
(mRNA)

NM_000179
NM_001281492
NM_001281493
NM_001281494

NM_010830

RefSeq
(タンパク質)

NP_000170
NP_001268421
NP_001268422
NP_001268423

NP_034960

場所
(UCSC)Chr 2: 47.7 ? 47.81 MbChr 2: 88.28 ? 88.3 Mb
PubMed検索[3][4]
ウィキデータ

閲覧/編集 ヒト閲覧/編集 マウス

MSH6 (mutS homolog 6) は、ヒトではMSH6遺伝子にコードされる、DNAミスマッチ修復に関与するタンパク質である。GTBP（G/T binding protein）、p160とも呼ばれる。MSH6タンパク質はDNA損傷修復に関与するMutS（Mutator S）ファミリーのタンパク質である。

MSH6の欠陥は、アムステルダム基準（英語版）を満たさない非定型遺伝性非ポリポーシス大腸癌（HNPCC）と関係している。MSH6の変異は子宮体癌とも関連している。
発見

MSH6はMSH2との相同性に基づいて、出芽酵母Saccharomyces cerevisiaeで最初に同定された。ヒトのGTBP遺伝子の同定とその後のアミノ酸配列の決定により、酵母のMSH6とヒトのGTBPは他のどのMutSホモログよりも関連性が高く、アミノ酸の同一性は26.6%であることが示された[5]。そのため、GTBPはMSH6（hMSH6）へと改名された。
構造

ヒトゲノムにおいて、MSH6遺伝子は2番染色体（英語版）に位置する。MSH6にはWalker-A/Bアデニンヌクレオチド結合モチーフが存在し、このモチーフは全てのMutSホモログに存在する最も保存性の高い配列である[6]。他のMutSホモログと同様、MSH6はATPアーゼ活性を有する。MSH6はMSH2と結合してヘテロ二量体を形成した場合にのみ機能するが、MSH2はホモ二量体、もしくはMSH3（英語版）とのヘテロ二量体としても機能することができる[7]。
機能

一般的に、DNAのミスマッチはDNA複製のエラー、遺伝的組換えやその他の化学的・物理的因子によって生じる[8]。こうしたミスマッチの認識と修復は細胞にとって極めて重要であり、適切に行われない場合にはマイクロサテライト不安定性（英語版）、変異率の上昇（mutator phenotype）、HNPCCに対する感受性が生じる[6][9]。MSH6はMSH2と共にMutSαと呼ばれるタンパク質複合体を形成する。この複合体によるミスマッチの認識はADP結合型からATP結合型への変換によって調節されており、MutSα複合体が分子的スイッチとして機能していることの証拠となっている[10]。正常なDNAでは、アデニン（A）はチミン（T）と結合し、シトシン（C）はグアニン（G）と結合している。