KHDRBS3

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5ELR, 5ELS, 5EMO, 5ELT, 5EL3


識別子
記号 ⇒KHDRBS3, Etle, SALP, SLM-2, SLM2, T-STAR, TSTAR, etoile, KH domain containing, RNA binding, signal transduction associated 3, KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 3
外部IDOMIM: 610421 MGI: ⇒1313312 HomoloGene: 4780 GeneCards: KHDRBS3

遺伝子の位置 (マウス)

染色体15番染色体 (マウス)[1]

バンドデータ無し開始点68,800,269 bp[1]
終点68,973,060 bp[1]

RNA発現パターン

⇒さらなる参照発現データ

遺伝子オントロジー
分子機能? ⇒SH3 domain binding
? ⇒血漿タンパク結合
? ⇒RNA結合
? ⇒核酸結合
? ⇒protein domain specific binding
? ⇒identical protein binding

細胞の構成要素? ⇒細胞核
? ⇒核質

生物学的プロセス? ⇒regulation of transcription, DNA-templated
? ⇒transcription, DNA-templated
? ⇒mRNA processing
? ⇒regulation of mRNA splicing, via spliceosome
? ⇒protein complex oligomerization

出典: ⇒Amigo / QuickGO

オルソログ
種ヒトマウス
Entrez

10656

13992

Ensembl

n/a

⇒ENSMUSG00000022332

UniProt

⇒O75525,E5RJZ9

⇒Q9R226

RefSeq
(mRNA)

NM_006558

NM_010158

RefSeq
(タンパク質)

NP_006549

NP_034288

場所
(UCSC)n/aChr : 68.8 ? 68.97 Mb
PubMed検索[2][3]
ウィキデータ

閲覧/編集 ヒト閲覧/編集 マウス

KHDRBS3（KH domain containing, RNA binding, signal transduction associated 3）またはT-STARは、ヒトではKHDRBS3遺伝子にコードされるタンパク質である[4][5][6]。
相互作用

KHDRBS3はSIAH1（英語版）と相互作用することが示されている[7][8]。

またKHDRBS3は前立腺がん細胞において、スプライシングタンパク質Sam68やがんタンパク質メタドヘリンと相互作用している[9]。
臨床的意義

KHDRBS3（T-STAR）は、前立腺がん組織で周囲の良性組織よりも発現が増加していることが示されている[9]。KHDRBS3の発現は、Likert scaleによって測定されるマルチパラメトリックMRI（mpMRI）シグナルと相関している。Likert scaleは、PI-RADS（英語版）と類似したシステムである[9]。いまだ議論はあるものの、mpMRIシグナルはグリソンスコアの高さや腫瘍サイズ、臨床的にアグレッシブな前立腺がんと関係した組織病理学的特徴と相関している[10][11]。KHDRBS3の発現は心不全患者の不全部位の心筋で増加しており、そこでKHDRBS3はACTG1（英語版）、MYL2（英語版）、RYR2（英語版）、TNNI3（英語版）、TNNT2、TPM1（英語版）、TPM2（英語版）、TTNなど、サルコメア（英語版）の構成要素をコードするいくつかの重要なmRNAと相互作用している[12]。

前立腺がん細胞株ではKHDRBS3はアンドロゲンによって調節されているようであり、合成アンドロゲンR1881（英語版）の投与後にmRNAの発現が低下する[9]。
機能

KHDRBS3はサルコメアタンパク質であるチチンのmRNAの選択的スプライシングを調節しており、イントロンが保持される。iPS細胞由来心筋細胞におけるKHDRBS3の過剰発現はカルシウムトランジェントを増加させ、Fmaxの増加をもたらす[12]。
出典^ a b c ⇒GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000022332 - Ensembl, May 2017
^ .mw-parser-output cite.citation{font-style:inherit;word-wrap:break-word}.mw-parser-output .citation q{quotes:"\"""\"""'""'"}.mw-parser-output .citation.cs-ja1 q,.mw-parser-output .citation.cs-ja2 q{quotes:"「""」""『""』"}.mw-parser-output .citation:target{background-color:rgba(0,127,255,0.133)}.mw-parser-output .id-lock-free a,.mw-parser-output .citation .cs1-lock-free a{background:url("//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/6/65/Lock-green.svg")right 0.1em center/9px no-repeat}.mw-parser-output .id-lock-limited a,.mw-parser-output .id-lock-registration a,.mw-parser-output .citation .cs1-lock-limited a,.mw-parser-output .citation .cs1-lock-registration a{background:url("//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/d/d6/Lock-gray-alt-2.svg")right 0.1em center/9px no-repeat}.mw-parser-output .id-lock-subscription a,.mw-parser-output .citation .cs1-lock-subscription a{background:url("//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/a/aa/Lock-red-alt-2.svg")right 0.1em center/9px no-repeat}.mw-parser-output .cs1-ws-icon a{background:url("//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/4/4c/Wikisource-logo.svg")right 0.1em center/12px no-repeat}.mw-parser-output .cs1-code{color:inherit;background:inherit;border:none;padding:inherit}.mw-parser-output .cs1-hidden-error{display:none;color:#d33}.mw-parser-output .cs1-visible-error{color:#d33}.mw-parser-output .cs1-maint{display:none;color:#3a3;margin-left:0.3em}.mw-parser-output .cs1-format{font-size:95%}.mw-parser-output .cs1-kern-left{padding-left:0.2em}.mw-parser-output .cs1-kern-right{padding-right:0.2em}.mw-parser-output .citation .mw-selflink{font-weight:inherit}Human PubMed Reference:
^ Mouse PubMed Reference:
^ “T-STAR/ETOILE: a novel relative of SAM68 that interacts with an RNA-binding protein implicated in spermatogenesis”. Human Molecular Genetics 8 (6): 959?69. (June 1999). doi:10.1093/hmg/8.6.959. PMID 10332027. 
^ “Salpalpha and Salpbeta, growth-arresting homologs of Sam68”. Gene 240 (1): 133?47. (November 1999). doi:10.1016/S0378-1119(99)00421-7. PMID 10564820. 
^ “Entrez Gene: KHDRBS3 KH domain containing, RNA binding, signal transduction associated 3”. 2023年7月1日閲覧。
^ “Towards a proteome-scale map of the human protein-protein interaction network”. Nature 437 (7062): 1173?8. (October 2005). Bibcode: 2005Natur.437.1173R. doi:10.1038/nature04209. PMID 16189514. 
^ “SIAH1 targets the alternative splicing factor T-STAR for degradation by the proteasome”. Human Molecular Genetics 13 (14): 1525?34. (July 2004). doi:10.1093/hmg/ddh165. PMID 15163637. 
^ a b c d “The Oncogene Metadherin Interacts with the Known Splicing Proteins YTHDC1, Sam68 and T-STAR and Plays a Novel Role in Alternative mRNA Splicing”. Cancers 11 (9): 1233. (August 2019). doi:10.3390/cancers11091233. PMC 6770463. PMID 31450747. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC6770463/.