開会式は2016年8月5日にエスタジオ・ド・マラカナンで挙行された。オリンピックの開会式が陸上競技場以外の会場で開催されたのは、1900年のパリオリンピック以来、116年ぶりのことである。オリンピック憲章に指示された通り、式典は（歓迎スピーチ、オリンピック旗の掲揚、選手らの入場行進を含む）国際的なスポーツイベントの開幕を示す格式が高い儀式と、開催国の文化を披露する芸術的なショーを兼ねたものである。開会式の会場には約78,000人の観衆が詰めかけた。[27]開会式のクリエイティブ・ディレクターには、フェルナンド・メイレレス、ダニエラ・トマス（英語版、フランス語版、ポルトガル語版）、そしてアンドルーチャ・ワディントン（英語版、フランス語版、ポルトガル語版）が、エグゼクティブ・プロデューサーにはトリノオリンピック、ソチオリンピックのセレモニーを手がけたマルコ・バリッチが就いた[28]。ブラジルで最も著名なコレオグラファーのデボラ・コルカー（英語版、フランス語版、ポルトガル語版）は、6000人を超えるボランティアの出演者を用意して、開会式で踊らせた。式のリハーサルは2016年5月の終わり頃に始まった。[29]

ジルマ・ルセフ大統領が弾劾により職務停止となったために、ミシェル・テメル大統領代行が国家元首として開会宣言をした。

オリンピック栄誉賞（英語版、スペイン語版、イタリア語版）が創設されて初めての受賞者（キプチョゲ・ケイノ）が選ばれ、鳩凧を揚げたケニアのオリンピックキッズと共にケイノは入場した。

なお、オリンピック開催に莫大な費用がかかるために、一部市民によるデモなど反対運動がおこり、開会式の際も会場の周辺でデモ隊と機動隊の衝突が発生した。
閉会式安倍晋三詳細は「2016年リオデジャネイロオリンピックの閉会式」を参照

2016年8月21日、フェルナンド・メイレレス総監督が執った閉会式が、開会式同様にエスタジオ・ド・マラカナンで挙行され、開催都市のリオデジャネイロから次回開催都市の東京へオリンピック旗が引き継がれた。
問題点

2014年5月、当時のジョン・ダウリング・コーツIOC副会長が、リオデジャネイロの準備状況について「過去最悪」と表現した。競技施設の建設の遅れなどを指摘している[30]。

高犯罪率「レベル1: 十分注意してください。」発出、および黄熱病、デング熱やジカウイルス、狂犬病などの感染症。防犯対策、予防接種などの詳細は、下記外部リンクの総領事館ウェブサイトを参照。

ジカウイルス

2016年、ブラジルではジカウイルスが蚊によって拡散されつづけている。第一ベクターは蚊であるが、危険な性交渉によって、そのウイルスが人から人へ感染することもありうる。WHOは、妊婦は引き続きジカウイルス伝染地域への渡航を控えるよう推奨した[31]。また、もし妊婦のパートナーが伝染地域から戻ってきた場合には、性交渉を安全に行うか、もしくは妊娠中は性交渉を控えるべきであるとの声明も出している。安全な性交渉とは、コンドームを正しく使うことなどである[31]。