2001年のMLBドラフト（2001 First-Year Player Draft）とは、6月5日から6日にかけて行われたMLBのアマチュアドラフトである。
1巡目指名

= オールスターゲーム選出

順位選手チーム守備位置学校
1ジョー・マウアーミネソタ・ツインズ捕手Cretin-Derham Hall High School
2マーク・プライアーシカゴ・カブス投手南カリフォルニア大学
3デウォン・ブラゼルトンタンパベイ・デビルレイズ投手ミドルテネシー州立大学
4ガビン・フロイドフィラデルフィア・フィリーズ投手マウントセントジョゼフ高校
5マーク・テシェイラテキサス・レンジャーズ三塁手ジョージア工科大学
6ジョシュ・カープモントリオール・エクスポズ投手カリフォルニア大学
7クリス・スミスボルチモア・オリオールズ投手カンバーランド大学
8ジョン・バンベンショーテンピッツバーグ・パイレーツ投手ケント州立大学
9ジョナサン・グリフィンカンザスシティ・ロイヤルズ投手Marshall, TX
10クリス・バークヒューストン・アストロズ遊撃手テネシー大学
11ケニー・ボーデトロイト・タイガース投手ライス大学
12マイク・ジョーンズミルウォーキー・ブルワーズ投手Phoenix, AZ
13ケイシー・コッチマンアナハイム・エンゼルス一塁手Seminole, FL
14ジェイコブ・ゴートルーサンディエゴ・パドレス一塁手/三塁手チューレーン大学
15ゲイブ・グロストロント・ブルージェイズ左翼手オーバーン大学
16クリス・ホネルシカゴ・ホワイトソックス投手Providence Catholic High School
17ダニエル・デンハムクリーブランド・インディアンス投手Antioch, CA
18アーロン・ハイルマンニューヨーク・メッツ投手ノートルダム大学
19マイク・フォンテノーボルチモア・オリオールズ二塁手ルイジアナ州立大学
20ジェレミー・ソワーズ*シンシナティ・レッズ投手Louisville, KY
21ブラッド・ヘネシーサンフランシスコ・ジャイアンツ投手ヤングスタウン州立大学
22ジェイソン・バルジャーアリゾナ・ダイヤモンドバックス投手バルドスタ州立大学
23ジョンフォード・グリフィンニューヨーク・ヤンキース右翼手フロリダ州立大学
24マッケイ・マクブライドアトランタ・ブレーブス投手Sylvania, GA
25ボビー・クロスビーオークランド・アスレチックス遊撃手カリフォルニア州立大学ロングビーチ校
26ジェレミー・ボンダーマンオークランド・アスレチックス投手Pasco, WA
27ウィリアム・ホーン*クリーブランド・インディアンス投手Marianna, FL
28ジャスティン・ポープセントルイス・カージナルス投手セントラルフロリダ大学
29ジョシュア・バラスアトランタ・ブレーブス遊撃手Marietta, GA
30ノア・ロウリーサンフランシスコ・ジャイアンツ投手ペパーダイン大学