1996年のMLBドラフト（1996 First-Year Player Draft）とは、1996年6月に行われたMLBのアマチュアドラフトである。
1巡目指名

= オールスターゲーム選出

順位選手チーム守備位置学校
1クリス・ベンソンピッツバーグ・パイレーツ投手クレムゾン大学
2トラビス・リーミネソタ・ツインズ一塁手サンディエゴ州立大学
3ブレイデン・ルーパーセントルイス・カージナルス投手ウィチタ州立大学
4ビリー・コッチトロント・ブルージェイズ投手クレムゾン大学
5ジョン・パターソンモントリオール・エクスポズ投手West Orange-Stark High School
6セス・グライシンガーデトロイト・タイガース投手バージニア大学
7マット・ホワイトサンフランシスコ・ジャイアンツ投手Waynesboro Area High School
8チャド・グリーンミルウォーキー・ブルワーズ外野手ケンタッキー大学
9マーク・コッツェイフロリダ・マーリンズ外野手カリフォルニア州立大学フラトン校
10エリック・チャベスオークランド・アスレチックス三塁手Mount Carmel High School
11アダム・イートンフィラデルフィア・フィリーズ投手Snohomish High School
12ボビー・シーエイシカゴ・ホワイトソックス投手Sarasota High School
13ロブ・ストラットンニューヨーク・メッツ外野手San Marcos High School
14ディー・ブラウンカンザスシティ・ロイヤルズ外野手Marlboro Central High School
15マット・ハローランサンディエゴ・パドレス遊撃手Chancellor High School
16ジョー・ローレンストロント・ブルージェイズ遊撃手Alfred M. Barbe High School
17トッド・ノエルシカゴ・カブス投手North Vermillion High School
18R・A・ディッキーテキサス・レンジャーズ投手テネシー大学
19マーク・ジョンソンヒューストン・アストロズ投手ハワイ大学
20エリック・ミルトンニューヨーク・ヤンキース投手メリーランド大学カレッジパーク校
21ジェイク・ウェストブルックコロラド・ロッキーズ投手Madison County High School
22ギル・メッシュシアトル・マリナーズ投手Acadiana High School
23ダミアン・ロールズロサンゼルス・ドジャース三塁手F.L. Schlagle High School
24サム・マーソネックテキサス・レンジャーズ投手Jesuit High School
25ジョニー・オリバーシンシナティ・レッズ外野手Lake-Lehman Junior/Senior High School
26ジョシュ・ギャレットボストン・レッドソックス投手South Spencer High School
27A・J・ザップアトランタ・ブレーブス一塁手Center Grove High School
28ダニー・ピープルズクリーブランド・インディアンス一塁手テキサス大学

1巡目補足指名

順位選手チーム守備位置学校
29ポール・ワイルダータンパベイ・デビルレイズ外野手Cary High School
30ニック・ビーアブロットアリゾナ・ダイヤモンドバックス投手Millikan High School