日中戦争の勃発後は、西南聯合大学で教鞭を執り、主として魏晋南北朝史、隋唐史、および元?・白居易の詩に関する研究などを講じた。1939年、イギリスのオックスフォード大学の中国史の教授に招聘され、1940年9月、昆明から香港へ行き、渡英の準備をするが、戦争によって渡航不能となってしまった。香港大学の客員教授に任じられ、中国文学系の主任となったが、1941年、香港が陥落し、香港大学は閉校されてしまった。1942年7月、桂林に赴き、広西大学で教鞭を執る。1943年12月には、成都に至り、燕京大学教授となる。
1946年、再度、清華大学の教授に任じられる。1948年、広州の嶺南大学へ移る。1952年、嶺南大学が中山大学に編入され、以後は中山大学の教授として、歴史系・中文系の講座で、両晋南北朝史、唐史、唐代の楽府などの課程を講義した。1960年7月、中央文史研究館の副館長に招聘される。文化大革命中、紅衛兵の打撃対象とされ、迫害を受け、長年かかって集めた所蔵の書籍と原稿が全て焼却された。1969年10月7日、広州で死去。
家族・親族
祖父：陳宝箴は湖南巡撫で変法派だったが、戊戌の政変で失脚した。死因は自尽させられた（戊戌の恨み、西太后の命令）。
父：陳三立は有名な詩人で、三江師範学堂の総教席に任じられたこともあった。死因は餓死（日中戦争、七七）。
主な著作
陳寅恪魏晋南北朝史講演録
隋唐制度淵源略論稿
唐代政治史述論稿
元白詩箋証稿
金明館叢稿初編
柳如是別傳
伝記
陸鍵東 『中国知識人の運命 陳寅恪最後の二十年』 平凡社、2001年荒井健・福田知可志・田口一郎・野原康宏訳
表
話
編
歴
文化大革命 (1966 – 1976)
前史
三反五反運動
反右派闘争
大躍進
大飢饉
廬山会議
中ソ対立
反党小説劉志丹事件
四清運動
七千人大会
主要事件
一月風暴（中国語版）
二月抗争（中国語版）
六十一人叛徒集団事件
武漢事件
上山下郷運動
国家主席の廃止
林彪事件（五七一工程（中国語版））
批林批孔運動（中国語版）
海城地震
板橋ダム決壊事故
四五天安門事件
唐山地震
毛沢東死去
北京政変
撥乱反正（中国語版）
主な虐殺
赤い八月
広西虐殺
道県事件（中国語版）
内モンゴル人民革命党粛清事件
沙甸事件（中国語版）
主要人物
中国共産党指導部
毛沢東
周恩来
劉少奇
鄧小平
朱徳
林彪
四人組（江青・張春橋・姚文元・王洪文）
陳伯達
謝富治
康生
毛遠新
戚本禹
華国鋒
汪東興
林彪グループ
林彪
葉群
林立果
陳伯達
謝富治
林彪派四天王（黄永勝・呉法憲・李作鵬・邱会作）
李雪峰（中国語版）
失脚した政治家
彭徳懐
呉晗
彭真
羅瑞卿
陸定一
楊尚昆
ウランフ
薄一波
劉少奇
鄧小平
陶鋳
賀竜
陳毅
葉剣英
李富春
李先念
徐向前
聶栄臻
谷牧
蕭華
楊成武
胡耀邦
張愛萍
万里
李立三
迫害を受け亡くなった人物
張東?
老舎
傅雷（中国語版）
孫維世
熊十力
容国団
趙九章
翦伯賛（中国語版）
周作人
田漢
陳寅恪
趙樹理
王瑩
張志新
遇羅克
その他
聶元梓
張承志
張鉄生
文書
新編歴史劇『海瑞罷官』を評す（海瑞罷官）
五・一六通知
司令部を砲撃せよ
一六箇条の決定（中国語版）
毛主席語録
毛沢東選集
工業は大慶に学べ（中国語版）（大慶市）／農業は大寨に学べ（中国語版）（大寨村）
貴方がやれば、私は安心だ（中国語版）
概念
四旧（破四旧運動（中国語版））
批闘大会（中国語版）
全国大武闘（中国語版）（武漢事件・清華大学百日大武闘）