国立大学法人長崎大学発足以後の2005年4月1日制定。商標登録されている。
正式ロゴマーク
オランダ船の舳先にNU (Nagasaki University) の頭文字を付け、右肩に大學の字を配したマークが以前から使用されてきた。このマークの正確な図柄が不明確であったため、精緻化するとともに従来のマークにやや動きを加え、新たに船出した国立大学法人長崎大学を表すものとして制定した。日本が鎖国下にあった江戸時代、長崎の出島がオランダを含む海外との数少ない窓口であった歴史に因む[12]。
略式ロゴマーク
長崎のNを模した略式ロゴマークである。左側（青色）が「地域・日本国土」を取り巻く「広大な海とその先にある国際社会」を、中央（黄色）の線は「学生・教職員」を、点は「創造」を、右側（緑色）は自然環境の豊かな「地域・日本国土」を、これらの図形の重なりはそれぞれの分野での「調和と貢献」を表している。 1962年（昭和37年）、学内公募により制定。入学式、卒業式で歌われている。作詞：平尾勇（当時は長崎大学商業短期大学部助教授）作曲：有浦滋（当時は経済学部4年）編曲：青木義勇（当時は長崎大学医学部教授、長崎大学管弦楽団団長） 2009年度までは各学科が独立していたが、2010年（平成22年）度に4系統7学科になり、2011年（平成23年）度から1学科6コース制となった。 2005年度-2010年度の構成
学歌
組織
学部
経済学部
総合経済学科
経済と政策コース（2014年度より改組）
グローバル経済コース（2014年度より改組）
ファイナンスコース
経営と会計コース
総合経済コース（夜間主、2022年度入学をもって募集停止）
教育学部教育学部棟
学校教育教員養成課程
小学校教育コース（子ども理解系／教科授業開発系／離島・地域文化系）
中学校教育コース（国語専攻／社会専攻／英語専攻／数学専攻／理科専攻／保健体育専攻）
幼児教育コース
特別支援教育コース
医学部
医学科
研究医コース
保健学科（4年制）
看護学専攻
理学療法学専攻
作業療法学専攻
歯学部
歯学科
歯学研究コース
薬学部薬学部棟
薬学科（6年制）
薬科学科（4年制）
工学部工学部棟
工学科
機械工学コース
電気電子工学コース
情報工学コース
構造工学コース
社会環境デザイン工学コース
化学・物質工学コース
機械システム工学系
機械システム工学科（機械工学・システム工学系）
電気情報工学系
電気電子工学科（電気工学・電子工学系）
情報システム工学科（情報工学・システム工学系）
環境システム工学系
構造工学科（土木工学・建築工学・機械工学系）
社会開発工学科（都市工学・土木工学系）
化学・材料開発系
材料工学科
応用化学科（工業化学系）
水産学部水産学部棟
水産学科
海洋生産管理学コース
海洋生物科学コース
海洋応用生物化学コース
海洋環境科学コース
環境科学部全学教育棟・環境科学部棟
環境科学科
環境政策コース
環境保全設計コース
多文化社会学部総合教育研究棟
多文化社会学科
グローバル社会コース
共生文化コース
社会動態コース
オランダ特別コース
情報データ科学部2020年（令和2年）4月設置[1]
情報データ科学科
インフォメーションサイエンスコース(IS)
