手塚治虫のデビュー40周年を記念して出版された。『手塚治虫アニメ名作集』（全16巻）の中で1 - 3巻が『鉄腕アトム』の名作集となっている[注 30]。本項目では『鉄腕アトム』の名作集のみ表記している。 本項目では『鉄腕アトム』関連の文庫全集のみ表記している。他作品については手塚治虫文庫全集#作品を参照されたい。
『手塚治虫アニメ名作集(1) 鉄腕アトム① アトムのたんじょう』1985年5月27日第1刷発行、ISBN 4-06-190701-8
『手塚治虫アニメ名作集(2) 鉄腕アトム② すてきなプレゼント』1985年6月14日第1刷発行、ISBN 4-06-190702-6
『手塚治虫アニメ名作集(3) 鉄腕アトム③ アトムとウランちゃん』1985年9月14日第1刷発行、ISBN 4-06-190703-4
手塚治虫文庫全集
手塚治虫 『鉄腕アトム』 講談社〈手塚治虫文庫全集〉、全10巻
本巻（全9巻）
2009年10月9日発売[58]、ISBN 978-4-06-373701-1
2009年10月9日発売[59]、ISBN 978-4-06-373702-8
2009年10月9日発売[60]、ISBN 978-4-06-373703-5
2009年11月11日発売[61]、ISBN 978-4-06-373704-2
2009年11月11日発売[62]、ISBN 978-4-06-373705-9
2009年12月11日発売[63]、ISBN 978-4-06-373706-6
2009年12月11日発売[64]、ISBN 978-4-06-373707-3
2010年1月8日発売[65]、ISBN 978-4-06-373708-0
2010年1月8日発売[66]、ISBN 978-4-06-373709-7
別巻（全1巻）
2010年1月8日発売[67]、ISBN 978-4-06-373733-2
手塚治虫 『アトムキャット』 講談社〈手塚治虫文庫全集〉、2009年12月11日発売[68]、ISBN 978-4-06-373731-8
手塚治虫 『アトム今昔物語』 講談社〈手塚治虫文庫全集〉、2010年1月8日発売[69]、ISBN 978-4-06-373732-5
手塚治虫以外による作品
手塚治虫（原作） / 姫川明（作画） 『ASTRO BOY 鉄腕アトム』 小学館〈てんとう虫コミックススペシャル〉、全3巻
詳細は「アストロボーイ・鉄腕アトム#コミカライズ」を参照
手塚治虫（原作） / 浦沢直樹（作画） 『PLUTO』 小学館〈ビッグコミックス〉、全8巻
詳細は「PLUTO#書誌情報」を参照
手塚治虫（原作） / 西島大介（作画） 『アトムちゃん』 角川書店〈単行本コミックス〉、2009年10月1日発行（9月28日発売[70]）、ISBN 978-4-04-854394-1
手塚治虫（原作） / 姫川明（作画） 『青騎士 鉄腕アトム青騎士より』 角川書店〈角川コミックス・エース〉、2010年4月22日発売[71]、ISBN 978-4-04-715434-6
手塚治虫（原案） / ゆうきまさみ（コンセプトワークス） / カサハラテツロー（作画） 『アトム ザ・ビギニング』 ヒーローズ〈ヒーローズコミックス〉、既刊19巻（2023年9月5日現在）
詳細は「アトム ザ・ビギニング#書誌情報」を参照
愛蔵版
手塚治虫 『豪華愛蔵版 鉄腕アトム』 朝日ソノラマ、全3巻
1978年12月8日発行、ISBN 4-257-90016-4
1978年12月25日発行、ISBN 4-257-90017-2
1979年1月31日発行、ISBN 4-257-90018-0
手塚治虫 『豪華愛蔵版 鉄腕アトム』 講談社〈講談社コミックス〉、全15巻7巻以降については、公式サイトにて発売日の記述がされているため発売日も併記している。
1992年11月24日第1刷発行、ISBN 4-06-313358-3
1992年11月24日第1刷発行、ISBN 4-06-313360-5
1992年11月18日第1刷発行、ISBN 4-06-313364-8