1984年1・2号より、創刊以来使用されていた誌名ロゴを一新する。1983年に発売されて読者層に注目されたファミリーコンピュータのゲームソフト紹介コーナーが「ファミコン神拳」を皮切りとして登場した。1984年12月の年末最終号（1985年3・4合併号）で公称発行部数が400万部を突破。「きまぐれオレンジ☆ロード」「男坂」「ドラゴンボール」（1984年 -）、「シティーハンター」「ついでにとんちんかん」「魁!!男塾」（1985年 -）、「聖闘士星矢」「赤龍王」「空のキャンバス」「県立海空高校野球部員山下たろーくん」（1986年 -）などが連載。
1987年 - 1989年

1988年2月23日発売の1988年13号で創刊号から1000号を達成し[13]、この年に創刊20周年を迎える。さらには1988年12月の年末最終号（1989年3・4合併号）で公称発行部数が500万部を突破。「ジョジョの奇妙な冒険」「燃える!お兄さん」「ゴッドサイダー」「THE MOMOTAROH」（1987年 -）、「BASTARD!! -暗黒の破壊神-」「ろくでなしBLUES」「ジャングルの王者ターちゃん」「神様はサウスポー」「まじかる☆タルるートくん」「ボクはしたたか君」（1988年 -）、「DRAGON QUEST -ダイの大冒険-」「電影少女」（1989年 -）などが連載。
1990年代1991年のマクラーレンのF1カー。フロントノーズに「ジャンプ」のロゴが貼ってある。
1990年 - 1993年

「花の慶次」「SLAM DUNK」「珍遊記 -太郎とゆかいな仲間たち-」「幽☆遊☆白書」（1990年 -）、「アウターゾーン」「ペナントレース やまだたいちの奇蹟」（1991年 -）、「モンモンモン」「ボンボン坂高校演劇部」「BOY」「究極!!変態仮面」（1992年 -）、「地獄先生ぬ?べ?」「NINKU -忍空-」「とっても!ラッキーマン」「D・N・A2 ?何処かで失くしたあいつのアイツ?」（1993年 -）などが連載。

1990年からゴールデンウィークに合併号が発刊されるようになった。また、1991年からはお盆の合併号が刊行開始。その前のお盆の合併号は1972年に34･35合併号が一度あったのみだった。

1990年から1992年までF1チーム『マクラーレン』のスポンサーになり、巻頭のカラーページに特集記事が組まれる。同時にF1を題材とした作品が数点掲載された。

1993年31号で創刊25周年を迎える。記念イベントとしてこの年の夏休みに、創刊以来最大規模となるイベント「週刊少年ジャンプ創刊25周年特別企画 ジャンプマルチワールド」を東京後楽園で開催。19日間の開催期間で約16万人を動員した。公称発行部数は1991年3・4号で602万部を突破。週刊誌が全国紙の発行部数を抜いたとして一般メディアも報道する。
1994年 - 1996年

「王様はロバ?はったり帝国の逆襲?」「るろうに剣心 -明治剣客浪漫譚-」「みどりのマキバオー」（1994年 -）、「陣内流柔術武闘伝 真島クンすっとばす!!」「レベルE」「セクシーコマンドー外伝 すごいよ!!マサルさん」（1995年 -）、「WILD HALF」「幕張」「封神演義」「遊☆戯☆王」（1996年 -）などが連載。

1994年11号から綴じ方が変更になった。1994年10号まではホチキス止めだったが、この号より広く見やすくなった。

1994年12月の1995年3・4号で653万部の歴代最高部数を達成するが、その後1995年25号で「ドラゴンボール」、1996年27号で「SLAM DUNK」と、看板作品が立て続けに終了し、公称発行部数が減少に転ずる。