建造物 建造物（34棟） （指定年月日）
本殿 - 1863年建造
権殿 - 1863年建造
重要文化財
本殿権殿取合廊 - 1863年頃建造
本殿東渡廊取合廊 - 1863年頃建造
西渡廊 - 1628年建造
透廊 - 1628年建造
渡廊 - 1628年建造
祝詞舎 - 1628年建造
塀中門 - 1628年頃建造
摂社若宮神社本殿 - 1628年建造
東渡廊 - 1628年建造
四脚中門 - 1628年建造
御籍屋 - 1628年建造
神宝庫 - 1628年建造
唐門 - 1628年頃建造
東御供所 - 1628年頃建造
直会所 - 1628年頃建造
楽所及び西御供所 - 1628年頃建造
幣殿 - 1628年建造
忌子殿 - 1628年頃建造
幣殿忌子殿取合廊 - 1628年頃建造
高倉殿 - 1628年頃建造
楼門 - 1628年建造
廻廊 2棟 - 1628年頃建造
摂社新宮神社本殿及び拝殿 2棟 - 1628年建造
摂社片岡神社本殿及び拝殿 2棟 - 1628年建造
片岡橋 - 明治初年建造
拝殿（細殿） - 1628年建造
舞殿（橋殿） - 1863年建造
土屋（到着殿） - 1628年建造
楽屋 - 1628年建造
外幣殿 - 1628年建造
北神饌所（庁屋）（奈良神社拝殿付属） - 1628年建造
（以下は「附（つけたり）」指定物件）
（唐門の附）
唐門左右袖塀 2棟
（四脚中門の附）
末社棚尾社本殿
（本社の附）
摂社須波神社本殿
玉橋
末社杉尾社本殿
末社土師尾社本殿
明治34年（1901年）8月2日 - 本殿、権殿など24棟が古社寺保存法に基づく特別保護建造物（文化財保護法下の「重要文化財」に相当）に指定。
明治36年（1903年）4月15日 - 拝殿（細殿）、舞殿（橋殿）、土屋（到着殿）、楽屋、外拝殿、北神饌所（庁屋）の6棟が特別保護建造物に指定。
昭和28年（1953年）3月31日 - 本殿、権殿が文化財保護法に基づき国宝に指定。
昭和42年（1967年）6月15日 - 摂社若宮神社本殿、摂社新宮神社本殿及び拝殿（2棟）、摂社片岡神社本殿及び拝殿（2棟）、片岡橋の6棟を重要文化財に追加指定。