かつて1980年には1,358の貨物駅が存在したが、1984年2月1日国鉄ダイヤ改正においてヤード集結型輸送が全廃されたことで、その7割は役目を終えて廃止されることとなった[5]。
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札幌貨物ターミナル駅

北旭川駅

北見駅

富良野貨物駅

帯広貨物駅

釧路貨物駅

苫小牧貨物駅

東室蘭駅

函館貨物駅

東北

東青森駅

八戸貨物駅

北沼駅（八戸臨海鉄道）

盛岡貨物ターミナル駅

水沢駅

石巻港駅

仙台港駅（仙台臨海鉄道）

仙台北港駅（仙台臨海鉄道）

仙台埠頭駅（仙台臨海鉄道）

仙台西港駅（仙台臨海鉄道）

仙台貨物ターミナル駅

岩沼駅

郡山貨物ターミナル駅

小名浜駅（福島臨海鉄道）

大館駅

秋田貨物駅

酒田港駅

関東

宇都宮貨物ターミナル駅

東鷲宮駅

安中駅

倉賀野駅

岡部駅

熊谷貨物ターミナル駅

日立駅

土浦駅

神栖駅（鹿島臨海鉄道）

千葉貨物駅（京葉臨海鉄道）

京葉久保田駅（京葉臨海鉄道）

越中島貨物駅

隅田川駅

越谷貨物ターミナル駅

新座貨物ターミナル駅

拝島駅