括弧内はPK戦のスコア。
1回戦2回戦3回戦準々決勝準決勝決勝 関東第一 v 野洲 #012016年12月30日 関東第一1 - 0野洲 駒沢陸上競技場 北陸 v 鹿児島城西 #022016年12月31日 北陸0 - 1鹿児島城西 等々力陸上競技場 桐光学園 v 長崎総科大附 #032016年12月31日 桐光学園0 - 2長崎総科大附 等々力陸上競技場 鹿島学園 v 高川学園 #042016年12月31日 鹿島学園2 - 1高川学園 ニッパツ三ツ沢球技場 藤枝明誠 v 東海大仰星 #052016年12月31日 藤枝明誠1 - 2東海大仰星 ニッパツ三ツ沢球技場 正智深谷 v 立正大淞南 #062016年12月31日 正智深谷2 - 1立正大淞南 NACK5スタジアム大宮 聖和学園 v 海星 #072016年12月31日 聖和学園2 - 0海星 浦和駒場スタジアム 帝京長岡 v 徳島市立 #082016年12月31日 帝京長岡1 - 1徳島市立 浦和駒場スタジアム 中京 v 大分 #092016年12月31日 中京1 - 4大分 柏の葉公園総合競技場 秋田商 v 滝川第二 #102016年12月31日 秋田商0 - 2滝川第二 柏の葉公園総合競技場 市立船橋 v 京都橘 #112016年12月31日 市立船橋1 - 0京都橘 フクダ電子アリーナ 前橋育英 v 明徳義塾 #122016年12月31日 前橋育英3 - 0明徳義塾 フクダ電子アリーナ 旭川実 v 米子北 #132016年12月31日 旭川実0 - 3米子北 NACK5スタジアム大宮 佐野日大 v 和歌山北 #142016年12月31日 佐野日大1 - 0和歌山北 味の素フィールド西が丘 山梨学院 v 岡山学芸館 #152016年12月31日 山梨学院1 - 0岡山学芸館 駒沢陸上競技場 尚志 v ルーテル学院 #162016年12月31日 尚志4 - 2ルーテル学院 駒沢陸上競技場 東福岡 v 東邦 #172017年1月2日 東福岡1 - 0東邦
#17
東福岡 1
東邦 0
#33
東福岡 3
#2
鹿児島城西 0
北陸 0
#18
鹿児島城西 1
鹿児島城西 0 (4)
#3
長崎総科大附 0 (2)
桐光学園 0
#41
長崎総科大附 2
東福岡 0
#4
東海大仰星 1
鹿島学園 2
#19
高川学園 1
鹿島学園 0
#5
東海大仰星 1
藤枝明誠 1
#34
東海大仰星 2
東海大仰星 2
富山第一 0
#20
富山第一 4
那覇西 1
#45
東海大仰星 1
青森山田 2
#21
創造学園 1 (4)
広島皆実 1 (2)
#35
創造学園 0
#1
正智深谷 3
関東第一 1
#22
野洲 0
関東第一 1
#6
正智深谷 2
正智深谷 2
#42
立正大淞南 1
正智深谷 1
#7
青森山田 3
聖和学園 2
#23
海星 0
聖和学園 1 (4)
#8
徳島市立 1 (2)
帝京長岡 1 (4)
#36
徳島市立 1 (5)
聖和学園 0
青森山田 5
#24
鵬翔 0
青森山田 5
#47
青森山田 5
前橋育英 0
#25
鵬学園 0
佐賀東 4
#37
佐賀東 0
#9
滝川第二 5
中京 1
#26
大分 4
大分 0
#10
滝川第二 6
秋田商 0
#43
滝川第二 2
滝川第二 0
#11
前橋育英 2
市立船橋 1
#27
京都橘 0
市立船橋 0 (3)
#12
前橋育英 0 (5)
前橋育英 3
#38
明徳義塾 0
前橋育英 1
遠野 0
#28
遠野 2
松山北 0
#46
前橋育英 1
佐野日大 0
#29
山形中央 0
一条 1
#39
一条 2 (3)
#13
佐野日大 2 (4)
旭川実 0
#30
米子北 3
米子北 0
#14
佐野日大 1
佐野日大 1
#44
和歌山北 0
佐野日大 2
#15
駒澤大高 1
山梨学院 1
#31
岡山学芸館 0
山梨学院 2
#16
尚志 1
尚志 4
#40
ルーテル学院 2
山梨学院 0
駒澤大高 4
#32
高松商 0
駒澤大高 1
1回戦
14:05
冨山大輔 61分 ⇒公式記録 (PDF)
観客数: 13,596人
主審: 福島孝一郎
14:10
⇒公式記録 (PDF)大脇瑞城 6分
観客数: 9,707人
主審: 植松健太朗
12:05
⇒公式記録 (PDF)右田翔 7分
薬真寺孝弥 69分
観客数: 8,314人
主審: 川俣秀
12:05
上田綺世 70分, 77分 ⇒公式記録 (PDF)淺野竜生 63分
観客数: 5,223人
主審: 松本大
14:10
中道慶人 48分 ⇒公式記録 (PDF) 23分 (OG)
松井修二 49分
観客数: 7,238人
主審: 鶴岡将樹
12:05
田島帆貴 47分
小山開喜 50分 ⇒公式記録 (PDF)梅木翼 37分
観客数: 6,043人
主審: 田中玲匡
12:05
藤井僚哉 75分
西堀駿太 78分 ⇒公式記録 (PDF)
観客数: 4,796人
主審: 藤田優
14:10
陶山勇磨 44分 ⇒公式記録 (PDF)郡紘平 46分
PK戦
楜澤健太
齋藤日向
石川悠
木村勇登
陶山勇磨 4 - 5 吉田顕世
高畑勇人
上野謙太朗
橋本日向
郡紘平
観客数: 3,312人
主審: 勝部健
14:10
赤堀凌太郎 2分 ⇒公式記録 (PDF)山本光彦 14分
嶋津翔太 21分
永松涼介 34分
川ア脩斗 79分
観客数: 岩崎創一
主審: 2,652人
12:05
⇒公式記録 (PDF)山田裕也 9分
本田周作 30分
観客数: 1,837人
主審: 石丸秀平
12:05
杉山弾斗 66分 ⇒公式記録 (PDF)
観客数: 16,061人
主審: 宇田賢史
14:10
飯島陸 39分
馬場拓哉 53分, 58分 ⇒公式記録 (PDF)
観客数: 10,016人
主審: 国吉真樹
14:10
⇒公式記録 (PDF)山室昂輝 4分
伊藤龍生 8分, 40+1分
観客数: 3,157人
主審: 橋本真光
12:05
長崎達也 6分 ⇒公式記録 (PDF)
観客数: 2,944人
主審: 鹿島裕史
12:05
42分 (OG) ⇒公式記録 (PDF)
観客数: 4,787人
主審: 赤阪修
14:10
渡部公平 12分, 69分
進藤雅也 45分
井上真冬 63分 ⇒公式記録 (PDF)谷本玲弥 27分
永田紘基 36分
観客数: 6,720人
主審: 先立圭吾
2回戦
14:10