[17][7]
過去の分類

かつては体型などから真獣下綱を化石種も含めて4つの「区」に分けていた。（†は目単位で化石種）

有爪区

食虫目

皮翼目

翼手目

霊長目

†裂歯目（Tillodontia）

†紐歯目

貧歯目

有鱗目


山鼠区

齧歯目

兎目


無足区

鯨目


猛獣有蹄区

猛獣上目

食肉目


原蹄上目

†?節目

†滑距目

†南蹄目

†雷獣目

管歯目


近蹄上目

†汎歯目

†恐角目

†異蹄目（Xenungulata）

†火獣目

海牛目

†束柱目

長鼻目

†重脚目

岩狸目


中軸上目

奇蹄目


側軸上目

偶蹄目

[18][19]

有爪区は原始食虫類から直接分離したと考えられたもので、山鼠区はネズミとウサギの仲間を束ねたもの、体形が他の哺乳類と大きく異なるクジラは独立の区に入れられ、当時単系統と考えられてた有蹄類全般と体型的に近い食肉目は一つの区に束ねられていた[18]。

エオマイア化石

ザランブダレステス下顎

ムツオビアルマジロ（異節上目）

アフリカゾウ（アフリカ獣上目）

コモンツパイ（真主齧上目）

フィリピンオオコウモリ（ローラシア獣上目）

注釈^ 祖先に異なるSINE配列を持った複数のグループが存在した事。通常はこの状態は長続きせず、いずれ一つの配列パターンに落ち着く。

出典^ Rook, Deborah L.; Hunter, John P. (April 2013). “Rooting Around the Eutherian Family Tree: the Origin and Relations of the Taeniodonta”. Journal of Mammalian Evolution 21: 75?91. doi:10.1007/s10914-013-9230-9. 
^ 『哺乳類の進化』 48?49頁
^ a b 『哺乳類の進化』 50頁
^ 『絶滅哺乳類図鑑』 12頁
^ 『絶滅哺乳類図鑑』 41頁
^ 『「退化」の進化学』 75 - 76頁
^ a b ⇒哺乳類の系統分類（渡邊誠一郎）
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^ Archibald, J David (2001), ⇒“Eutheria (Placental Mammals)”, Encyclopedia of Life Science, ⇒http://www.bio.sdsu.edu/faculty/archibald/Archibald01Eutheria.pdf 
^ Carter, A.M.; Mess, A. (2007), ⇒“Evolution of the Placenta in Eutherian Mammals”, Placenta 28 (4): 259?62, ⇒http://www.anslab.iastate.edu/Class/AnS536w/03%20Placental%20Physiology/Carter2006.pdf 
^ ⇒http://www.sciencemag.org/content/339/6120/662
^ ⇒レトロポゾンが書き込んだ哺乳類の歴史（2006.05.23）
^ 産経ニュース 【科学】哺乳類の進化　大陸分裂→３系統に分岐
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