1978年（昭和53年）、瀬谷西高校の建設工事で奈良時代と思われる横穴墓が検出され、人骨が出土した。同時に盗掘のあとも見つかっている。正門から校舎に向かう道路の下部付近である。
鎌倉時代

南北を縦断する鎌倉街道（かまくら道）の上道は、当時の主要な街道の一つであり、源頼朝、日蓮、新田義貞などが通った跡が残されている。

源頼朝は、石橋山の戦いに敗れ安房に逃れた後、態勢を建て直し鎌倉攻めをする前夜に、相沢の諏訪社で宿泊・夜陣を張ったという言い伝えがある。

日蓮は晩年、鎌倉を出発し中原街道を通り池上に向かう途中、妙光寺に立ち寄った。

新田義貞は、世野ヶ原（現在の瀬谷）で、20万を越える勢力の陣揃えをして鎌倉攻めの準備をした。


阿久和は鶴岡八幡宮の荘園だったという記録が残されている。八幡宮の財政が一時期悪化されたときに地頭色部氏売却されたが、徳政令によって返還された。

室町・戦国時代

応永23年（1416年）に起きた上杉禅秀の乱では、上杉・足利持仲と江戸・豊島の両軍が世谷原の戦いで戦った。主な戦場は鎌倉台（楽老峰）・中丸山で、破れた上杉軍は、鎌倉道を敗走していった。

宝徳のころ（1450年ごろ）、上杉定正の家臣、山田経光（? - 文明2年(1470年)）が瀬谷・大和を治めていた（『新編相模国風土記稿』巻之六十四）。居住は瀬谷の中屋敷で大和の深見城を本拠にしていた。現在でも区内に中屋敷、馬場屋敷、牢場坂などの居館址に由来する地名が残されている。境川に架かる上瀬谷橋は、架け替えられる前は山田橋という名前であった。牢場坂では牢屋が置かれた場所とも馬事訓練が行われていたともいわれている。

享禄2年（1529年）上杉朝興と後北条氏との間で合戦が起き、後北条氏側が勝利した。この時北条氏康は初陣を上げている。この時も中丸山・基ヶ峰（細谷戸東方の丘陵）が主戦場になっている。

後北条氏の時代、瀬谷は御馬廻衆（旗本）の久米玄蕃之助、阿久和は小机衆増田駿河守満栄の知行であった。また「皇国地誌」によれば、瀬谷は、永禄年間は北条氏政の家臣で久米の小姓であった松波内蔵の采地であったことが記録されている。本郷に居を構えていた伝わっている。

久米玄蕃の所領は、現在の埼玉県坂戸市森戸であったことが「小田原衆所領役帳」に残されており、他に相模国西郡別堀、そして瀬谷を合わせて101貫67文を領していた。

増田駿河守満栄は現在の川崎市高津区の一部を含め141貫を領していた。阿久和の中村に屋敷があったと伝えられている。


相模風土記によると、後北条氏に対し瀬谷の村民は軍備調達への租税に税銭不納運動を起こしたことが記載されている。

甲斐武田氏が滅亡した時武田家ゆかりの者の一部が瀬谷に土着したと言われ、区内の善昌寺は支族岩崎丹後守が一族を弔うために開基したと伝えられている。ちなみに三菱の創始者岩崎弥太郎も岩崎家の流れを汲んでいるとされている。岩崎家はその後長田家支配の上瀬谷地域の名主となる。

江戸時代

天正6年（1578年）中原街道沿いの瀬谷（現在の北新、宗川寺あたり）に問屋場が設けられる。天正18年（1590年）、石川弥治右ヱ門重久に経営が委嘱された。二ツ橋には、荷物などの受け渡しを行う継立場が設けられた。

徳川家康は東海道よりも中原街道を利用することが多く、「駿府記」によると天正18年（1590年）の江戸入府の際にも利用している。また遺言により、駿府から日光に分骨されるときにも利用された。

二ツ橋で「しみじみと 清き流れの清水川 かけ渡したる 二ツ橋かな」と詠み、現在では二ツ橋に石碑が設置されている。

三ツ境駅北部にある楽老峰という名前は、徳川家康が訪れた際に命名したと言われている（当時は美屋古山と呼ばれていた）。家康が駿河に行く途中ここで休憩をし、住民が差し出した茶湯を飲んだという。記念碑が楽老峰南公園にある。

徳川家康が瀬谷を通過した際、瀬谷の絶景を「瀬谷八景」と命名した。二ツ橋の三叉路（現在の二ツ上橋交差点付近）、中丸山北条氏康古戦場、上瀬谷の城山（大和市の深見城と考えられる）、五〆目（現在の五貫目町）、竹谷戸（現在の竹村町）の鎌倉道、山田橋（現在の上瀬谷橋）、別太郎塚の狩場（上瀬谷通信隊の中にあり破壊されている）、伊賀守の中屋敷。

宮沢村でも、家康が鷹狩りをしたという言い伝えがある。


瀬谷村に知行地を持つ旗本は後藤家、長田家、本多家。阿久和村は安藤家。宮沢村は石川家が治めていた。二ツ橋は天領であった。

二ツ橋は、天正年間に瀬谷郷にあった芝地を露木甚左衛門らによって開墾され、藤沢宿の支配下に置かれた。二ツ橋の千駄野（現区役所周辺）からは藤沢宿にある藤沢御殿に萱を納めていた。しかし年貢は年々増加し村人たちが正しい検知を実施することを要求し、享保10年（1725年）検知が行われ、韮山代官所支配の幕府直轄領に移行され、日野家、大貫家を経て江川家が代官を務めた（二ツ橋に宿場があったのも一因）。正徳4年（1714年）、日野小左ヱ門正晴は屋敷を中原街道と相鉄線が交差するところに、代官陣所を現在の二ッ上橋の交差点の辺りに置いた。文政7年（1824年）にも、不作でも減免しない領主に対して、農民が代官に窮状を訴えている記録がある。江川英龍が二ツ橋に巡視に来た際には、露木源兵衛宅に宿泊したという記録がある。

宮沢は、石川重政が徳川家康関東入国により天正20年（1592年）に賜った土地で、重政は、戸塚区上矢部に屋敷を置き、寒川町大蔵、海老名市望地、大和市下草柳に計687石を賜っている。寛永年間（1625年 - 1635年）に上矢部の3軒の住民が、宮沢の荒地を開墾して集落を作ったのが始まりとされている。

石川家は有力旗本として、重政の子重次は普請奉行、以下代々、小姓組や御書院番などを務めた。


中瀬谷は、後藤忠直が慶長5年（1600年）に知行地として与えられたもので300石あった。忠直は、島津氏の庶流長徳軒の孫で、長徳軒（島津運久の子で別名忠貞）は享禄年間薩摩を出奔後、北条氏綱に招かれ相模に居住した。忠直は、北条滅亡後、徳川家康に見いだされ、旗本となった。代々御書院番などを務める。2代後の久利の時、島津に改姓。天保15年（1844年）、江戸城で大火があり、瀬谷で植樹していた椰の木を伐採して中原街道で送り、江戸城復興に一役買ったと伝えられている。現在では南台に石碑ができ、近くに「梛の木石碑前」というバス停もある。久利から3代後の久武のとき後藤姓に戻る。宗川寺に墓地が残っている。

幕末の資料「視聴草」によると、後藤忠正（島津）の長女である大橋局は、徳川秀忠夫人お江与の方に仕えていたが、秀忠の寵愛を一時期受けてしまい身ごもってしまったので、家康は後藤光次（庄三郎）の妾として下げ渡された。


上瀬谷は平良兼の流れをくむ長田家領で、妙光寺に墓地が残されている。長田家は、家康・秀忠の鷹匠を務めていた。瀬谷駅近くに鷹見塚が残されている。長田家の先祖の一人長田左衛門尉親致は源義朝を討ち取っている。

相沢は代官采配の村であったが、本多一族の康重の家系を組む旗本の本多紀品が采地として明和4年（1767年）に賜った。火付盗賊改に任命された時であった。紀品は『鬼平犯科帳』にも登場する。石高は2000石で、江戸屋敷は番町（現千代田区）にあった。御目付衆を務めた。

相沢の名主は、永野家が務め代々藤兵衛を名乗っていた。地元には「頭巾かぶりの藤兵衛さん」という民話が残されている。


阿久和は、徳川家康の関東入国にあたり、安藤治（次）右衛門に分配された。初代定次は伏見城の戦いで戦死、2代治（次）右衛門正次は阿久和の熊野神社から大坂の陣に出陣し、夏の陣で戦死した。