年度作品監督
2006年
第61回時をかける少女細田守
2007年
第62回河童のクゥと夏休み原恵一
2008年
第63回スカイ・クロラ The Sky Crawlers押井守
2009年
第64回サマーウォーズ細田守
2010年
第65回カラフル原恵一
2011年
第66回蛍火の杜へ大森貴弘
2012年
第67回おおかみこどもの雨と雪細田守
2013年
第68回かぐや姫の物語高畑勲
2014年
第69回ジョバンニの島西久保瑞穂
2015年
第70回百日紅?Miss HOKUSAI?原恵一

第71回 -

年度作品監督
2016年
第71回君の名は。[9]新海誠
2017年
第72回こんぷれっくす×コンプレックス[10]ふくだみゆき
2018年
第73回若おかみは小学生![11]高坂希太郎
2019年
第74回海獣の子供[12]渡辺歩
2020年
第75回魔女見習いをさがして[13]佐藤順一
鎌谷悠
2021年
第76回岬のマヨイガ[14]川面真也
2022年
第77回高野交差点[8]伊藤瑞希
2023年
第78回アリスとテレスのまぼろし工場[15]岡田麿里

脚注^ ⇒毎日映画コンクール選考方法 - 毎日新聞
^ ⇒毎日映画コンクールとは - 毎日新聞
^ “第70回毎日映画コンクール　アニメーション部門候補に「バケモノの子」「ここさけ」「百日紅」など”. アニメ!アニメ!. (2015年12月21日). https://animeanime.jp/article/2015/12/21/26197.html 2016年1月23日閲覧。 
^ 大藤信郎賞は、本賞創設以前に『ルパン三世 カリオストロの城』（ただし受賞対象は制作会社の東京ムービー新社名義）・『天空の城ラピュタ』・『となりのトトロ』で、創設以後は『崖の上のポニョ』『君たちはどう生きるか』で受賞。
^ 大藤信郎賞を受賞した『セロ弾きのゴーシュ』は、本賞創設以前の作品で、受賞対象は制作会社であるオープロダクションの名義になっている。
^ “毎日映画コンクール初の快挙??完全自主映画のワキ毛青春アニメ『こんぷれっくす×コンプレックス』がアニメーション映画賞を受賞！”. シネフィル. (2018年1月19日). https://cinefil.tokyo/_ct/17143193 2021年8月28日閲覧。 
^ 自主制作アニメ界の新星『高野交差点』伊藤瑞希（監督）×中田秀人（原案・脚本）対談�@ - 『Febri』（2022年11月22日）2023年1月19日閲覧。
^ a b “「第77回毎日映画コンクール」『ケイコ 目を澄ませて』最多5冠 沢田研二、岸井ゆきのら受賞”. ORICON NEWS. oricon ME (2023年1月19日). 2023年1月19日閲覧。
^ “毎日映画コンクールで「シン・ゴジラ」が大賞ほか3冠獲得、「君の名は。」は2冠”. 映画ナタリー. (2017年1月19日). https://natalie.mu/eiga/news/217340 2017年1月19日閲覧。 
^ “毎日映画コンクールで大林宣彦「花筐」が大賞！菅田将暉＆長澤まさみが主演賞に”. 映画ナタリー. (2018年1月18日). https://natalie.mu/eiga/news/265688 2018年1月18日閲覧。 
^ “柄本佑＆安藤サクラ、夫婦そろって受賞　大賞は『万引き家族』！第73回毎日映画コンクール受賞結果”. シネマトゥデイ (2019年1月23日). 2019年1月23日閲覧。
^ “「蜜蜂と遠雷」が日本映画大賞など３冠　毎日映画コンクール”. 時事通信. (2020年1月22日). https://web.archive.org/web/20200122091038/https://www.jiji.com/jc/article?k=2020012200742&g=soc 2020年1月22日閲覧。 
^ “魔女見習いをさがして：「毎日映画コンクール」アニメーション映画賞受賞　「おジャ魔女どれみ」20周年記念作”. まんたんウェブ. (2021年1月22日). https://mantan-web.jp/article/20210121dog00m200057000c.html 2021年1月22日閲覧。