長良川の支川

長島川（新川・長島川放水路）

桑原川

犀川※

境川（新荒田川・岩戸川・岩地川）

大江川

荒田川（論田川）

糸貫川

伊自良川※

両満川

山田川

津保川※

福富川

武儀川（エゴ川・西洞川・日永谷川・出戸川・船越川・神崎川・伊往戸川）

余取川

板取川（片知川・神洞川・半道川・柿野川・川浦谷川・西ケ洞谷川）

粥川

亀尾島川

吉田川（小駄良川）

神路川

落部谷川

栗巣川（古道川）

大間見川（小間見川）

牛道川（阿多岐川・板倉川）

曽部地川

鷲見川

犀川の支川

天王川（中川・天王川放水路）

新堀川（高野川・新高野川）

五六川（起証田川）

宝江川

長護寺川

政田川

伊自良川の支川

古根尾川

板屋川

早田川

則武川

新堀川

正木川

鷺山川

鳥羽川（天神川・新川・石田川・椎倉川・東川・椿川）

城田寺川

しびり川

津保川の支川

関川

吉田川

蜂屋川

詰田川

川浦川（大洞川・廿屋川・太市川・納古川）

小野川

志津野川

轡野川

祖父川川

中之保川

水成川

武儀倉川

小那比川

少合川


牧田川の支川

水門川（中之江川・新規川・加納川）

杭瀬川※

金草川（石畑川）

五日市川

藤古川（今須川）

赤尾川（東谷川）

杭瀬川の支川

小畑川

相川（色目川・大谷川・矢道川・薬師川・泥川・梅谷川・大滝川・岩手川・大栗毛川）

菅野川

奥川

東川

中川（深町川）



可児川の支川

矢戸川

横市川

久々利川（姫川・大森川・中郷川）

瀬田川

比衣川

真名田川

唐沢川

平芝川

切木川

津橋川

飛騨川の支川

深渡川

雄鳥川

飯田川

水無瀬川

尾賀野川

神淵川※

白川※

佐見川（稲田川・小野日陰川）

菅田川

馬瀬川※

門和佐川

竹原川（輪川・乗政川・神梨川・般若川・白山川）

山之口川（カジヤ谷川）

大ケ洞川

小坂川（大洞川・兵衛谷川）

無数河川

八尺川

青屋川（九蔵川）

秋神川

道後谷川