伝統的な分類による広義の有蹄類の単系統性が分子系統によって否定された後は、分子系統で単系統群と判明している[5][6]鯨偶蹄目と奇蹄目からなるクレードを有蹄類と再定義されることが多い。この意味での有蹄類を真有蹄類 (Euungulata) や鯨蹄類 (げいているい、Cetungulata) と呼ぶこともある[7][8]。
再定義された有蹄類の系統的位置[9][10][11][12][13]
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Boreoeutheria

Euarchontoglires 真主齧類
 
Laurasiatheria

Eulipotyphla 真無盲腸目
 
Scrotifera

Chiroptera 翼手目
 
Ferungulata

Pan-Euungulata

Euungulata 有蹄類 (鯨偶蹄類、奇蹄類ほか)
 
?

†Protungulatidae
 

 
Ferae

Pholidotamorpha (鱗甲目含む)
 
 

Pan-Carnivora (食肉目含む)
 

広獣類

猛獣有蹄類

陰嚢類

ローラシア獣類

北方真獣類

化石目を含む広義の有蹄類（多系統群）

有蹄類（広義・多系統群）
分類

ドメイン:真核生物 Eukaryota
界:動物界 Animalia
門:脊索動物門 Chordata
亜門:脊椎動物亜門 Vertebrata
綱:哺乳綱 Mammalia
亜綱:獣亜綱 Theria
下綱:真獣下綱 Eutheria
階級なし:有蹄類 Ungulata

下位分類群

本文参照

McKenna & Bell (1997) [14]に挙げられている、化石目も含めた広義の有蹄類を、最新の分類体系に落とし込むと以下のようになる。（McKenna & Bell 1997[14] による有蹄大目の分類[15]を現在広く使われている目名に修正[16]。）

真獣類 Eutheria

アフリカ獣類 Afrotheria

管歯目 Tubulidentata

近蹄類 Paenungulata

イワダヌキ目 Hyracoidea

重脚目 Embrithopoda †

テチス獣類 Tethytheria

海牛目 Sirenia

束柱目 Desmostylia †

長鼻目 Proboscidea




真主齧類 Euarchontoglires†

アルクトスティロプス目 Arctostylopida †（分類に議論あり）


北真獣類 Boreoeutheria

ローラシア獣類 Laurasiatheria

奇蹄目 Perissodactyla

鯨偶蹄目 Artiodactyla

メソニクス目 Mesonychia †

前肉歯目 Procreodi †

滑距目 Litopterna †

南蹄目 Notoungulata †



系統未定

顆節類 Condylarthra †

午蹄中目 Meridiungulata †

輝獣目 Astrapotheria †

異蹄目 Xenungulata †

火獣目 Pyrotheria †


恐角目 Dinocerata †

モエリテリウム目 Moeritheroidea †

特徴

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出典検索?: "有蹄類" ? ニュース ・ 書籍 ・ スカラー ・ CiNii ・ J-STAGE ・ NDL ・ dlib.jp ・ ジャパンサーチ ・ TWL（2023年10月）

ここでは、現生の蹄の発達した有蹄類である、偶蹄類・奇蹄目・長鼻目について述べる。

ひづめを持ち、蹄行性である。かかとは地面に付かない。ほとんどの場合、指は5本より減っている。

大型の草食動物であり、セルロースを消化できる。脊椎動物共通の性質として有蹄類も生化学的にはセルロースを分解できないため、分解は腸内細菌によるものである。腸内細菌の所在など細部の機構は目により異なる。
出典[脚注の使い方]^ Irwin, D.M. and Wilson, A.C. (1993). “Limitations of molecular methods for establishing the phylogeny of mammals, with special reference to the position of elephants”. In: F.S. Szalay, M.J. Novacek, and M.C. McKenna (eds.), Mammal Phylogeny: Placentals. pp. 257?267, Springer-Verlag, New York.
^ Peter J. Waddell, Hirohisa Kishino, Rissa Ota (2001). “A Phylogenetic Foundation for Comparative Mammalian Genomics”. Genome Informatics 12: 141?154, doi:10.11234/gi1990.12.141.
^ Cooper, L. N.; Seiffert, E. R.; Clementz, M.; Madar, S. I.; Bajpai, S.; Hussain, S. T.; Thewissen, J. G. M. (2014-10-08). "Anthracobunids from the Middle Eocene of India and Pakistan Are Stem Perissodactyls". PLOS ONE. 9 (10): e109232. Bibcode:2014PLoSO...9j9232C. doi:10.1371/journal.pone.0109232. PMC 4189980. .mw-parser-output cite.citation{font-style:inherit;word-wrap:break-word}.mw-parser-output .citation q{quotes:"\"""\"""'""'"}.mw-parser-output .citation.cs-ja1 q,.mw-parser-output .citation.cs-ja2 q{quotes:"「""」""『""』"}.mw-parser-output .citation:target{background-color:rgba(0,127,255,0.133)}.mw-parser-output .id-lock-free a,.mw-parser-output .citation .cs1-lock-free a{background:url("//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/6/65/Lock-green.svg")right 0.1em center/9px no-repeat}.mw-parser-output .id-lock-limited a,.mw-parser-output .id-lock-registration a,.mw-parser-output .citation .cs1-lock-limited a,.mw-parser-output .citation .cs1-lock-registration a{background:url("//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/d/d6/Lock-gray-alt-2.svg")right 0.1em center/9px no-repeat}.mw-parser-output .id-lock-subscription a,.mw-parser-output .citation .cs1-lock-subscription a{background:url("//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/a/aa/Lock-red-alt-2.svg")right 0.1em center/9px no-repeat}.mw-parser-output .cs1-ws-icon a{background:url("//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/4/4c/Wikisource-logo.svg")right 0.1em center/12px no-repeat}.mw-parser-output .cs1-code{color:inherit;background:inherit;border:none;padding:inherit}.mw-parser-output .cs1-hidden-error{display:none;color:#d33}.mw-parser-output .cs1-visible-error{color:#d33}.mw-parser-output .cs1-maint{display:none;color:#3a3;margin-left:0.3em}.mw-parser-output .cs1-format{font-size:95%}.mw-parser-output .cs1-kern-left{padding-left:0.2em}.mw-parser-output .cs1-kern-right{padding-right:0.2em}.mw-parser-output .citation .mw-selflink{font-weight:inherit}PMID 25295875.