日本人
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^ 文献等[要文献特定詳細情報]（2014年以前）ではO2b*と表記されているが、実際はO1b2（旧O2b）からO-47zを除いたものである。
^ a b 北朝鮮では調査がなされていない。
^ これは人口が少ない集団は遺伝的多様性が少なくなるからと考えられている。
^ なお、ウイグル人とヤクート人は西ユーラシア人との混血のため東アジアの主集団と離れていると考えられる。また韓国人は若干日本列島人と同様の乖離の傾向を示したため、わずかではあるが縄文人のDNAを含んでいる可能性が示唆された[152]。
^ ただし、北海道地域のサンプルはアイヌを選んだわけではないということに留意する必要がある
^ IK002の個体と現代の本土日本人との先祖としての一致は10％程、混血としては3.3％としている。
^ サンプルは北京の漢族。
^ サンプルは中国系シンガポール人。
^ 溝口は「本プロジェクト研究班の班員全員の合意によるものではない」と明記している[196][出典無効]。
^ 純粋な外国系日本人の数ははっきりしていないが、人口比で帰化が少ないことに加え、帰化者の子孫において混血が漸次進んでいることを考えると、割合少ない数であるといえる。
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