病名病原体発見年病原体発見者
ハンセン病らい菌（真正細菌）1875年アルマウェル・ハンセン（ノルウェー）
マラリアマラリア原虫（原虫）1880年シャルル・ルイ・アルフォンス・ラヴラン（フランス）
腸チフスサルモネラ属菌（真正細菌）1880年カール・エーベルト（ドイツ）
結核結核菌（真正細菌）1882年ロベルト・コッホ（ドイツ）
コレラコレラ菌（真正細菌）1883年ロベルト・コッホ（ドイツ）
ジフテリアジフテリア菌（真正細菌）1883年エミール・アドルフ・フォン・ベーリング（ドイツ）、北里柴三郎（日本）
破傷風破傷風菌（真正細菌）1884年アルトゥール・ニコライエル（ドイツ）
ブルセラ症ブルセラ属菌（真正細菌）1887年デビッド・ブルース（イギリス）
ペストペスト菌（真正細菌）1894年アレクサンドル・イェルサン（フランス語版）（フランス）、北里柴三郎（日本）
赤痢赤痢菌（真正細菌）1898年志賀潔（日本）
梅毒梅毒トレポネーマ（真正細菌）1905年フリッツ・シャウディン（ドイツ語版）（ドイツ）
百日咳百日咳菌（真正細菌）1906年ジュール・ボルデ（フランス）
チフス（パラチフス）サルモネラ属菌（真正細菌）1909年シャルル・ジュール・アンリ・ニコル（フランス）

光学顕微鏡では観察できない極小のウイルス(virus)の発見は、細菌よりも遅れ、1892年のロシアの植物学者ドミトリー・イワノフスキーによるタバコモザイクウイルスの発見が最初であった[7]。ウイルスによる感染症には、インフルエンザ、後天性免疫不全症候群 (AIDS)、エボラ出血熱、黄熱、狂犬病、重症急性呼吸器症候群 (SARS) 、中東呼吸器症候群 (MERS) 、デング熱、ジカ熱、天然痘、風疹、急性灰白髄炎（ポリオ）、麻疹、咽頭結膜熱（プール熱）、マールブルグ出血熱、ラッサ熱、ウエストナイル熱、日本脳炎、水痘・帯状疱疹、新型コロナウイルス感染症 (COVID-19) などがある。

ウイルスは、代謝系を持たず、細菌のように栄養を摂取してエネルギーを生産するような生命活動はおこなわない[9]。自己増殖できず、他生物の細胞に寄生することによって増殖し、エネルギーは宿主細胞の作るそれを利用し、大きさは細菌よりもはるかに小さい[9]。ウイルスの観察には電子顕微鏡が必要である[9]。
治療法の発見詳細は「抗生物質」、「抗ウイルス薬」、「ワクチン」、および「種痘」を参照フレミング（1881-1955）