明治4年（1871年）6月東京に移り、太政官権少史を務め、修史館に兼務し、明治6年（1873年）7月19日病没した[1]。
著書

弦堂日記 安政3年（1856年）8月16日 - 明治2年（1869年）3月5日[4]

弦堂日抄[5]

帰読軒日抄[6]

医事鈔[7]

中河内採薬記行 天保15年（1844年）8月9日 - 8月15日[2]

山城草木記[1]

詞林咀華[8]

親族

父：山本亡羊 - 本草学者。

母：玲子 - 華頂宮臣青木如水二女[9]。天明8年（1788年）12月13日生、享和2年（1802年）5月25日結婚、嘉永5年（1852年）2月18日没[10]。

兄：山本本太郎 - 文化6年（1809年）7月7日生、夭逝[11]。

兄：山本榕室 - 錫夫、沈三郎。家督を継いだ[11]。

弟：山本渓愚 - 章夫、藤十郎。画業を修めた[12]。

弟：山本確斎 - 正夫、余一郎。鳥飼に医業を開いた後、新政府に出仕した[13]。

弟：山本楓庭 - 善夫、十二郎。富田に医業を開いた後、度会県大属を務めた[14]。


妻 - 秋田藩邸留守居[15]小倉範兵衛娘[16]。安政5年（1858年）12月没[16]。

長男：立吉 - 慶応2年（1866年）11月没[10]。


脚注^ a b c d e f 中島 1909, pp. 43?44.
^ a b “西尾市岩瀬文庫古典籍書誌データベース”. 西尾市岩瀬文庫. 2016年1月6日閲覧。
^ “「今日は何の日」9月　私塾立命館の創設”. 立命館大学 (2013年9月3日). 2016年1月6日閲覧。
^ 松田 2014, p. 39.
^ 松田 2014, pp. 84, 111.
^ 松田 2014, p. 111.
^ 松田 2014, p. 332.
^ 松田 2014, p. 43.
^ 中島 1909, p. 39.
^ a b 松田 2014, p. 243.
^ a b 中島 1909, p. 40.