免許の種類船の大きさ航行区域取得年齢
1級小型船舶操縦士総トン数20トン未満無制限満18歳以上（満17歳9か月以上より受験可能）
1級小型船舶操縦士(5トン限定)総トン数5トン未満無制限満18歳以上（満17歳9か月以上より受験可能）
2級小型船舶操縦士総トン数20トン未満平水区域および海岸から5海里以内（約9km）満18歳以上（満17歳9か月以上より受験可能）
2級小型船舶操縦士(5トン限定)総トン数5トン未満平水区域および海岸より5海里以内（約9km）満16歳以上（満15歳9か月以上より受験可能）
2級小型船舶操縦士(湖川小出力限定)総トン数5トン未満エンジン20馬力未満湖・川満16歳以上（満15歳9か月以上より受験可能）
特殊小型船舶操縦士水上オートバイ-満16歳以上（満15歳9か月以上より受験可能）
1999年5月20日 - 2003年5月31日まで
主に5級区分の創設。
免許の種類船の大きさ航行区域取得年齢
1級小型船舶操縦士総トン数20トン未満無制限満18歳以上（満17歳9か月以上より受験可能）
2級小型船舶操縦士総トン数20トン未満沿海区域および海岸から20海里以内（約37km）満18歳以上（満17歳9か月以上より受験可能）
3級小型船舶操縦士総トン数20トン未満平水区域および海岸から5海里以内（約9km）満18歳以上（満17歳9か月以上より受験可能）
4級小型船舶操縦士総トン数5トン未満平水区域および海岸より5海里以内（約9km）満16歳以上（満15歳9か月以上より受験可能）
5級小型船舶操縦士総トン数5トン未満湖・川および海岸より1海里以内（約1.8km）満16歳以上（満15歳9か月以上より受験可能）
湖川小馬力5級小型船舶操縦士（限定5級免許）総トン数5トン未満エンジン10馬力未満湖・川および指定区域満16歳以上（満15歳9か月以上より受験可能）
1974年5月25日 - 1999年5月19日まで
免許の種類船の大きさ航行区域取得年齢
1級小型船舶操縦士総トン数20トン未満無制限満18歳以上
2級小型船舶操縦士総トン数20トン未満沿海区域および海岸から20海里以内（約37km）満18歳以上
3級小型船舶操縦士総トン数20トン未満平水区域および海岸から5海里以内（約9km）満18歳以上
4級小型船舶操縦士総トン数5トン未満平水区域および海岸より5海里以内（約9km）満16歳以上
試験
各地で不定期に行われている。学科試験は、一級、二級、特殊では四肢択一、二級（湖川小出力限定）では正誤式で出題される。
教習及び試験科目
身体検査
視力＝両眼ともに0.5以上（矯正視力可、片眼の視力が0.5に満たない場合、0.5以上見えるほうの眼の視野が150度以上あること）
色覚＝夜間において船舶の灯火（赤、緑、白）が識別できること
聴力＝5m以上離れた距離で話声語が識別できること（矯正可）
疾病及び身体機能の障害
学科
合格基準は各科目50%以上、総合65%以上である。
一般科目
1 小型船舶操縦者の心得及び遵守事項（一級、二級、特殊は12問出題（6問以上合格）、二級（湖川小出力限定）は10問出題（5問以上合格））- 一級、二級、二級（湖川小出力限定）、特殊は 水上交通の特性、小型船舶操縦者の心得、小型船舶操縦者の遵守事項
2 交通の方法（一級、二級は14問出題（7問以上合格）、二級（湖川小出力限定）は8問出題（4問以上合格）、特殊は10問出題（5問以上合格）- 一級、二級は一般海域での交通の方法、港内での交通の方法、特定海域での交通の方法、湖川及び特定水域での交通の方法、二級（湖川小出力限定）、特殊は一般水域での交通の方法、湖川及び特定水域での交通の方法、港内での交通の方法
3 運航（一級、二級は24問出題（12問以上合格）、二級（湖川小出力限定）は12問出題（6問以上合格）、特殊は18問出題（9問以上合格））- 一級、二級は操縦一般、航海の基礎、船体、設備及び装備品、機関の取扱い、気象及び海象、荒天時の操縦、事故対策、二級（湖川小出力限定）は操縦一般、航方の基礎知識、点検及び保守、気象及び海象の基礎知識、事故対策、特殊は運航上の注意事項、操縦一般、航海の基礎、点検及び保守、気象及び海象の基礎知識、事故対策
上級科目
4 上級運航I（一級のみの科目。8問出題（4問以上合格））- 航海計画、救命設備及び通信設備、気象及び海象、荒天航法及び海難防止
5 上級運航II（一級のみの科目。6問出題（3問以上合格））- 機関の保守整備、機関故障時の対処
実技
1 小型船舶の取扱い- 一級、二級は発航前の準備及び点検、解纜（らん。係留を解く）及び係留、結索、方位測定、二級（湖川小出力限定）は発航前の準備及び点検、解纜及び係留、結索、特殊は発航前の準備及び点検、結索
2 操縦（一級、二級は基本操作と応用操縦に分かれる）- 基本操作は安全確認（見張り及び機関の状態確認）、発進、直進及び停止、後進、変針、旋回及び連続旋回、応用操縦は回頭（五トン限定無し）、人命救助、避航操船、離岸及び着岸、二級（湖川小出力限定）は安全確認、発進、直進及び停止、変針、旋回、人命救助、離岸及び着岸、特殊は安全確認、発進、直進及び停止、旋回及び連続旋回、危険回避、人命救助
実技試験は一級、二級は総トン数5トン未満、長さ4メートル以上、9メートル未満の滑走型船を、二級（湖川小出力）は推進機関の出力が15kW未満、総トン数5トン未満、長さ3メートル以上、9メートル未満の船外機船を、特殊は定員3名の水上オートバイを用いて行われる。
海技士有資格者の科目免除
海技士 (航海)および海技士 (機関)併有の場合
学科試験のうち「交通の方法」「運航(特殊の「運航」は除く)」「上級運航Ⅰ及びⅡ」が科目免除となる。
海技士(航海)保有の場合
学科試験のうち「交通の方法」「運航（特殊の「運航」は除く）」「上級運航Ⅰ」が科目免除となる。
海技士(機関)保有の場合
学科試験のうち「上級運航Ⅱ」が科目免除となる。