一般に知られるのは阿保親王流で、賜姓に与った行平・業平兄弟の子孫が栄えた。
動向

初め高岳親王の男女に賜姓され、次いで阿保親王の子の行平・業平らに賜姓された。薬子の変に伴う平城上皇の失脚で政治的に困難な立場に置かれていたため、臣籍に降ることによって皇位継承の資格を放棄し、保身を図ったものと考えられる。したがって、賜姓後もしばらくは不遇の日々であったが、清和天皇の代には在原氏の家運も上昇。有力氏族により大学別曹が形成されるようになると、在原氏も奨学院を創設し、子女の教育にあたらせた。
その後

戦国時代、上杉氏家臣であった長野業正・業盛父子は業平の子孫とされ、石田三成の盟友大谷吉継は一説に行平の子孫ともいわれる。また、尾張国知多郡に興る荒尾氏は在原姓を称し、尾張織田家の重臣である平手政秀を出した平手氏もその出自とする説がある。
系譜 　　　　　　　在原氏

実線は実子、点線（縦）は養子、点線（横）は婚姻関係で表記している。

平城天皇

                                  
                               
阿保親王高岳親王

                                
                               
兼見王在原仲平[注釈 2]在原行平在原守平在原業平行慶在原善淵在原安貞

                                   
                             
弘景[注釈 2]女[注釈 3]遠瞻[注釈 4]友于基平[注釈 2]女[注釈 5]棟梁高階師尚[注釈 6]滋春[注釈 7]女[注釈 8]一貫[注釈 2]載春[注釈 2]

                                  
                                  
時春藤原元方[注釈 9]元清[注釈 2]女[注釈 10]戒仙[注釈 2]高滋[注釈 2]安平[注釈 2]時春安平高滋仲滋相安

           

女惟範滋澄業光陳俊

       

業正経澄朝見

       

宗屋滋元長野業朝

     

朝之(長野氏)

   

公之

   

見国

   

公見

   

公為

   


脚注[脚注の使い方]
注釈^ 詩の大意は「兄弟は争うことがあったとしても困難にあっては助け合うものである」。
^ a b c d e f g h i (生没年不詳)