真主齧類

グリレス類

齧歯目 Rodents
 
 

兎形目 Lagomorphs
 

Glires
真主獣類

霊長目 Primates
 
 

皮翼目 Dermoptera
 
 

登木目 Scandentians
 

Euarchonta

Euarchontoglires[35]
ローラシア獣類

真無盲腸目 Eulipotyphla（かつての食虫目の一部。詳細は同項参照)
 
 

翼手目 Chiroptera
 
 

奇蹄目 Perissodactyla
 
 

鯨偶蹄目 Cetartiodactyla
 
広獣類[33][34][31]

食肉目 Carnivora
 
 

鱗甲目 Pholidota
 

Ferae

 

Laurasiatheria[33][34]

Boreoeutheria[37][38]

Placentalia

Theria

Mammalia

上記の系統樹の凡例：

系統樹は2012年から2017年までの複数の引用文献（系統樹内を参照）、および2020年のサーベイ論文[44]を用いて作成した。

系統樹中に登場する引用は、その分岐を明示してある参考文献を記したものである。例えば「獣亜綱」のところについている引用（キャンベル11版 pp.852-853）は「獣亜綱」が「有袋類」と「有胎盤類」に分岐する事を記してある文献である

論文から引用した場合は、論文本体ではなく「Abstract」や「Introduction」の節からのみ引用した。これは論文本体の記述は（論文発表時点では）定説になっていない新説であるのに対し、これらの節は既存研究を客観的かつ網羅的に記載するためのものだからである。ただしサーベイ論文[44]や書籍[45]に関してはその限りではない。

上記の系統樹に対して生物学者の間でどの程度合意が取れているかは、系統樹の分岐箇所により異なるが、最初の

哺乳類

単孔類
 
獣亜綱

有袋類
 
 

有胎盤類
 

 

 

の部分に関しては、多くの化石の証拠と分子系統解析の結果から合意が取れている[30]。
有胎盤類

哺乳類 - 獣亜綱の下にあたる有胎盤類内の系統が

有胎盤類

アフリカ獣類
 
 

異節類
 
 

北方真獣類
 

 

という3つに分かれる事は概ね合意されている[46][47]。

なお、この3つの系統はパンゲア大陸の分裂と密接に関係している事が強く示唆されており[48][49]、実際パンゲア大陸の分裂により誕生したアフリカ大陸、南アメリカ大陸、ローラシア大陸に対応する地域にアフリカ獣類、異節類、北方獣類がそれぞれ分布する[48]。