天守は国宝（旧国宝）に指定されていたが、和歌山大空襲で焼失し、現在のものは、1850年（嘉永3年）の天守再建時の大工棟梁・水島平次郎の子孫である栄三郎が所蔵していた天守図と『御天守御普請覚張』を参考にして1958年（昭和33年）に再建されたものである。復元には東京工業大学名誉教授藤岡通夫の指示を受け、鉄筋コンクリート構造による外観復元とされた。復元設計にあたり、参考にされていた文献や図には天守群の高さが記入されていなかったため、焼失前に撮影された写真に写る他の建造物との高低比から天守群の高さが算出された。
二の丸

初代頼宣と14代茂承以外の藩主は、二の丸御殿に住んでいた。また、二の丸御殿は江戸城本丸御殿を模していたため、表・中奥・大奥に分かれていた。また、大奥があるのは、江戸城・和歌山城・名古屋城のみである。表は紀州藩の藩庁、中奥は藩主が執務を行う普段の生活空間、大奥は藩主の正室や側室たちの居所として機能した。現在、二の丸御殿の表・中奥に相当する場所は広場として開放され、大奥に相当する場所は芝生が養生され整備されている。
西の丸

西之丸庭園（紅葉渓庭園）鳶魚閣御橋廊下松の丸櫓高石垣重要文化財・岡口門追廻門

和歌山城西之丸庭園は、江戸時代初期に西の丸御殿とともに造られた日本庭園で、紅葉渓庭園とも呼ばれる藩主の隠居所であった。城の北西麓という地形を活かし、鳶魚閣や二段の滝が設けられている。しかし、戦災で天守などとともに焼失しその後、図面などを基にして1972年（昭和47年）に鳶魚閣が再建されたが、御橋廊下復元の際に再び庭園の池などの調査を行った。それによると、鳶魚閣は実際には現在の場所ではなく、池の中央付近にあったと推測されている。また、松下幸之助から茶室紅松庵が寄贈されている。西の丸庭園は、江戸時代初期の遺構を残す大名庭園として、国の名勝に指定されている。

また、鶴の渓門跡に浅野時代の鶴の渓庭園跡がある。西の丸庭園前の山吹谷は、徳川時代までは水堀であった。
御橋廊下

藩主が生活している二の丸と、庭園がある西の丸をつなげる傾斜のある橋。藩主が移動するのを気づかれないために、壁付になっていた。江戸時代の図面をもとに木造復元されており、実際に通ることができる。
三の丸

紀州藩の重臣である水野家や安藤家、三浦家などの上流藩士の邸宅が建ち並んでいた。廃藩置県の後は、公的機関や学校、商業施設、オフィス街になっている。
御蔵の丸

東堀沿いの石垣には、かつて多聞櫓が建てられていたため、城兵の昇降用の長大な雁木が残っている。
松の丸

松の丸櫓台から初代・頼宣が紀州富士（龍門山）を眺め、故郷の駿河国を偲んだといわれている。
城門
岡口門
浅野時代には大手門であったが、浅野時代の後期に大手門から搦手門として修復された。1621年（元和7年）に徳川頼宣が行った城の大改修の際に再建された櫓門が現存している。現在の門櫓は切妻屋根であるが当初は、門櫓の両側に続櫓があった。
追廻門
砂の丸の乗馬調練場と門外の扇の芝馬場を結ぶ門である。馬を追い回したことからそう呼ばれた。姫路城などに見られる旧型の高麗門である[9]。1984年（昭和59年）から翌1985年（昭和60年）にかけての解体修理により、江戸時代には朱が塗られていたことが分かり、赤門であったと見られている。赤門は御守殿（三位以上の大名家に嫁いだ徳川将軍家の娘）の住む御殿の門として建てられる、または御守殿を迎えた折りに門を赤く塗られたものをいうが、和歌山城の場合は二の丸の「御座の間」（藩主の居所）から見たとき裏鬼門（坤（南西））の方角に当たるため、魔除けのために赤く塗られたと推測されている。
京橋門
大手門（一之橋門）から北に伸びたところにあった櫓門。北堀（現・市堀川）に面しており、物見櫓もあったとされる。京橋の側に石碑が建つ。
本町門
京橋からさらに北にあり、真田堀に面したところにあった櫓門で城下町の境としていた。参勤交代の際は必ずこの門を通ったという。
不明門
「あかずの門」とも言われ、急を要する場合のみ開かれ、通常は閉じられたままであったという。和歌山城南側の三年坂に面した場所にあり、現在は和歌山城駐車場のゲートが置かれている。
吹上門
旧中消防署の前にあったとされる門。西側には吹上御門もあったとされるが明治期に埋め立てられた。現在、鳥居が建っている。
石垣和歌山城の石垣（野面積み）和歌山城の石垣（打込みハギ）

時代により石材や積み方の技法が異なっている。豊臣秀長の時代は緑色片岩を中心とした自然石を切り出してそのまま積んだ「野面積み」の石垣が作られた。浅野幸長の時代には、友ヶ島等に石切場を整備し、石を打ち欠いて加工しはぎ合わせて積む「打込みハギ」の石垣が作られた。徳川期には熊野の花崗斑岩を用いて、切石で精密に積んだ「切込みハギ」の石垣が作られた。[10]
文化財
重要文化財

岡口門（附：土塀）

市指定文化財

追廻門

国指定史跡

和歌山城

国指定名勝

和歌山城西之丸庭園（紅葉渓庭園）

県指定天然記念物

一の橋の樟樹

焼失した文化財

以下の建造物は、国宝保存法に基づく国宝（文化財保護法における「重要文化財」に相当）に指定されていたが、1945年（昭和20年）7月9日、戦災で焼失した[11]。