戦災からの復興の過程で、隣接する千駄ヶ谷地区には連れ込み宿が林立、原宿駅前にも同様の旅館が出現した[9]。それらを一掃しようという運動が近隣住民やPTAを中心に行われ、原宿駅を含む原宿地区は1957年（昭和32年）、文教地区の指定を受けた。その結果、風俗営業は姿を消した[9]。 表参道口にはトイレが設置され、改札外に東京地下鉄（東京メトロ）の明治神宮前駅への乗り換え口がある。コンコースとホームを連絡するエスカレーターとエレベーターが設置されており、バリアフリー措置が取られているが、竹下口にはこのような設備はなく、改札口があるのみである。また、竹下口にはお客さまサポートコールシステムが導入されており、早朝・深夜はインターホンによる案内となる[2]。 元々は島式ホーム1面2線として供用していたが、2020年（令和2年）3月21日より外回り（2番線）ホームを明治神宮に面する単式ホームに移し、方向別のホームとなった[報道 2]。それまでの明治神宮側のホーム（旧・3番線ホーム、1940年元日より供用開始[8]）は例年、明治神宮の初詣客が集中する期間のみ使用する臨時ホームとなっており、この際の外回り電車は臨時ホーム側で乗降を扱い、島式ホーム側（旧・2番線ホーム）は使用を中止していた。 番線路線方向行先 （出典：JR東日本:駅構内図 外回り・内回りともに当駅オリジナルのメロディが使われている[14]。なお、2011年3月1日から3月20日までは期間限定でmiwaの楽曲「春になったら」が採用され、1番線ではサビ、2番線では冒頭部を使用していた[15]。かつての臨時ホーム（3番線、現在の2番線）では発車ベルが使われていた。 1原宿a
1952年（昭和27年）10月14日：鉄道開業80周年を記念して「皇室専用ホーム」の一般公開を実施。復元された北海道最初の蒸気機関車「義經」「しづか」が展示された。
1972年（昭和47年）10月20日：帝都高速度交通営団（営団地下鉄）の明治神宮前駅が付近に開業。
1976年（昭和51年）7月：みどりの窓口の営業を開始[10]。
1987年（昭和62年）
4月1日：国鉄分割民営化に伴い、東日本旅客鉄道（JR東日本）の駅（山手線所属）となる。
7月1日：目白駅とともにホームの全面禁煙を試行（1994年9月まで[新聞 2]）[新聞 3]。なお、他の駅で喫煙コーナー設置による分煙が採用されたため、統一する形でいったん取りやめとなった後、2009年4月より再度全面禁煙化された。
1991年（平成3年）3月8日：表参道改札に自動改札機を設置[11]。
1992年（平成4年）12月4日：竹下口に自動改札機を設置[12]。
1997年（平成9年）：「関東の駅百選」に認定される[13]。選定理由は「神宮の森の緑とマッチしている西洋風の駅舎」[13]。
2001年（平成13年）11月18日：ICカード「Suica」の利用が可能となる[報道 1]。
2014年（平成26年）12月13日：ホームドアの使用を開始。
2017年（平成29年）1月31日：みどりの窓口の営業を終了。
2020年（令和2年）3月21日：新駅舎が供用開始[報道 2][新聞 4][新聞 5]。外回りホーム（旧2番線）が新ホームへと移動[報道 2][新聞 4][新聞 5]。
駅構造
のりば
1 山手線内回り渋谷・品川・浜松町・東京方面
2外回り新宿・池袋・上野方面
表参道改札と切符売り場（2020年3月）
竹下改札（2023年1月）
1番線ホーム（2022年8月）
2番線ホーム（2022年8月）
旧駅舎（2011年9月）
駅改良工事前の臨時ホームに立てられていた駅名板（2002年頃）
かつて明治神宮にあった臨時出入口（2019年12月）
発車メロディ
2原宿b
皇室専用ホーム皇室専用ホームの入口付近（2008年9月）
