また上記とは逆に『週マガ』にて主に活動する作家が『別マガ』にて作品を発表する機会も多く、真島ヒロ・小林尽・さとうふみや・樹林伸・吉河美希といった作家が読み切り・連載を発表している。この他にもインターネットを使用した数多くの独自企画が存在する。
歴代班長
朴鐘顕：2009年10月号（2009年10月1日発行、1巻1号通巻1号、創刊号） - 2013年7月号（2013年7月1日発行、5巻7号通巻46号）

鈴木一司：2013年8月号（2013年8月1日発行、5巻8号通巻47号） - 2016年6月号（2016年6月1日発行、8巻6号通巻81号）

川窪慎太郎：2016年7月号（2016年7月1日発行、8巻7号通巻82号） - 現職

なお奥付の編集人欄には少年マガジン編集部編集長の菅原喜一郎が記載されている。
掲載作品
連載漫画

連載中の作品については太字で表記。なお、連載中の作品のみの一覧はテンプレートを参照。

デフォルトでの表示順は連載開始順。開始号の同じ物に付いては掲載順とした。

可視性向上のため、一部の長い名称については便宜的な略称を用い、注記欄に正式な名称を記載している。略称を用いたものについては※を記載。

開始・終了欄ではyyyy年mm月号を「yyyy.mm」の形で略記。

移籍元/先については、備考欄で「←/→ 『 移籍元/先の雑誌名』」の形で略記。

2024年5月現在。

連載中

作品名作者（作画）原作者など開始終了注記
00ＺＺＺ2009年2009.00Ｚ Ｚ
01とうふつのくにどうぶつの国らいく まこと雷句誠?2009.10[注 2]2014.03
02ふあふあぷあぷあ?こんの とひろコンノトヒロ?2009.10[注 2]2012.12
03あくのはな惡の華おしみ しゆうそう押見修造?2009.10[注 2]2014.06
04ちようしんかくえん超人学園こくさわ ようすけ 石沢庸介?2009.10[注 2]2013.01
05ういさあとりいせおウィザードリィZEOふくはら れんし福原蓮士 （漫画）いわはら けいし岩原ケイシ（原案）2009.10[注 2]2011.04
06そんなみらいはうそてあるそんな未来はウソであるさくらは こはる桜場コハル?2009.10[注 2]2016.08
07はにらすはいたあバニラスパイダーあへ よういち阿部洋一?2009.10[注 2]2010.12
08あらしのてんせつ嵐の伝説さとう しよう佐藤将?2009.10[注 2]2011.10
09しんけきのきよしん進撃の巨人いさやま はしめ諫山創?2009.10[注 2]2021.05単行本発売月は
前号掲載分と合わせ2話掲載
10ろまんさんしゆうそう浪漫三重奏あわはこあわ箱?2009.10[注 2]2012.07
11てんしのとひと天使のトビトきい たかし記伊孝?2009.10[注 2]2010.05
12ほうらいかあるす蓬莱ガールズやまた ろう山田瑯?2009.10[注 2]2010.07
13ほちポチあさくら まる亜桜まる?2009.10[注 2]2010.04
14こいしのふ恋忍たかもと よねこ高本ヨネコ?2009.10[注 2]2011.04
15しよしらくじょしらくやすヤス（漫画）くめた こうし久米田康治（原作）2009.10[注 2]2013.10
16すすなり あやなししんきちきふんろくスズナリ! ?あやなし甚吉奇聞録?おおみね しようこ大峰ショウコ?2009.112010.03
17まるとうつくすくらんふるマルドゥック・スクランブルおおいま よしとき大今良時（漫画）うふかた とう冲方丁（漫画）2009.112012.06
18くりこりグリゴリはるま りよう春馬良?2009.112010.08創刊号に予告漫画掲載
19かうんとらふるカウントラブルなお あきなり奈央晃徳?2009.122012.12
19.5ＺＺＺ2010年2010.002010.00Ｚ
20さんかれあはっとり みつるはっとりみつる?2010.012014.10
21みふきしてん壬生義士伝ながやす たくみながやす巧（漫画）あさた しろう浅田次郎（原作）2010.022012.03←『コミックチャージ』(第一章)