日本での三線軌条および四線軌条は、1912年7月1日に、博多電気軌道（のちの西鉄福岡市内線、1435mm）が貨物輸送を目的として、一部の区間に1067mmの軌道を併設して貨物列車の運行を開始した事例があり[6]、この営業運行は次に述べる京都市内の例よりも早かった。京都市内の京都市電と京都電気鉄道の共用区間では、同年4月19日に京都市が内務省から三線軌条敷設の許可を受け、同年12月25日に三線軌条の最初の区間が営業を開始した。

翌1913年には東海道本線の膳所駅（当時は馬場駅） - 大津駅（後の浜大津駅）間で、東海道本線（貨物線）に大津電車軌道（現在の京阪電気鉄道石山坂本線）が乗り入れるため三線軌条となった。軌道ではない鉄道が関係するものはこれが最初である。

純粋な鉄道のみのものとしては1917年に横浜線の原町田駅 - 橋本駅間で、標準軌化の実地試験として使用されたのが始まりである（日本の改軌論争も参照）。

鉄道車両工場の構内で三線軌条となっているケースもある。例えば、JR東海浜松工場には狭軌・標準軌共用の三線軌条が多い。なお、ここでは営業線上以外のものは割愛する。

三線軌条の乗越分岐器（箱根登山鉄道〈現：小田急箱根〉 風祭駅、どちらも三線で分岐、2006年廃止）

三線軌条の分岐器（小田急電鉄・箱根登山鉄道〈現：小田急箱根〉 小田原駅、片方だけ三線で分岐、2006年廃止）

三線軌条の移線器（逗子線六浦駅）

現存するもの

海峡線の湯の里知内信号場付近に敷設された三線軌条


北海道旅客鉄道 北海道新幹線・海峡線：新中小国信号場 - 木古内駅 ※2016年（平成28年）3月26日共用開始。

北海道新幹線車両（定期旅客列車） = 標準軌

在来線車両（貨物列車・臨時旅客列車）= 狭軌（1,067 mm軌間・三六軌間）

この区間の中間駅である奥津軽いまべつ駅では本線・ホーム側待避線は標準軌、駅外側の待避線は狭軌のみ。湯の里知内信号場では本線は標準軌・狭軌の三線軌条、待避線は狭軌のみ。

この区間は架線電圧が25,000 Vのため、新幹線車両の他は、複電圧対応車両（EH800形とTRAIN SUITE 四季島）だけが自走可能で、従来の在来線（20,000 V）用電車・電気機関車の自走は不可能[7]。在来線定期旅客列車は2016年3月21日の運行をもって全廃された[8]。


奥羽本線，秋田新幹線の三線軌条（2011年8月10日、刈和野駅）

東日本旅客鉄道 奥羽本線・秋田新幹線：神宮寺駅 - 峰吉川駅（複線の一方が狭軌と併用）[9][10]

新幹線直通車両 = 標準軌

在来線車両 = 狭軌（1067mm軌間・三六軌間）

架線電圧は20000Vの共有でATSは標準軌がATS-P・狭軌はATS-SNを併設[11]。



小田急箱根 鉄道線：入生田駅 - 箱根湯本駅：入生田車庫出入庫車両（かつては小田原駅 - 箱根湯本駅の営業用だった。）

小田急箱根の車両 = 標準軌

小田急電鉄の車両 = 狭軌（1067mm軌間・三六軌間）

この区間は架線電圧が1500Vなので小田急箱根車両が複電圧車でATSは小田急電鉄仕様（OM-ATS）で両社共通になっている。



京浜急行電鉄 逗子線：金沢八景駅 - 神武寺駅：総合車両製作所横浜事業所入出場車両（複線の一方が狭軌と併用）

京急線の車両 = 標準軌

その他の車両 = 狭軌（1067mm軌間・三六軌間）、使用中は線路閉鎖して列車の運行を止める必要がある[12]


かつて存在したもの

奥羽本線（山形線）の山形駅-蔵王駅間に敷設されていた三線軌条の跡。現在は地上の固定子のみが残る


京都市電：四条西洞院 - 四条堀川など

京都市敷設路線=標準軌

京都電気鉄道敷設路線（N電）= 狭軌（1,067 mm軌間・三六軌間）

最も多いときには上記の他に烏丸通・丸太町通・七条通に合計4箇所存在したが、徐々に標準軌に統合され、戦後まで残ったのは上記四条通の区間のみ。1961年（昭和36年）8月1日、狭軌路線廃止。残った標準軌線（四条線）も1972年廃止された。


西鉄福岡市内線：三角駅 - 博多築港駅

吉塚線・循環線 = 標準軌

築港線 = 狭軌（1,067 mm軌間・三六軌間）

築港線が吉塚線・循環線と重複する区間が該当。貨物輸送をおこなう築港線のために三線軌条となっていた。1944年（昭和19年）12月3日に吉塚線の三角駅 - 吉塚駅前駅間が廃止となり、1,435 mmのレールを撤去。残った区間も1961年（昭和36年）2月11日に築港線の運行を休止、1963年（昭和38年）9月1日に築港線全線が廃止され、吉塚線・循環線は1,435 mmのみとなった。


京阪石山坂本線・東海道本線・江若鉄道：膳所駅 - 浜大津駅（片側線のみ）

京阪電気鉄道車両 = 標準軌

その他の車両 = 狭軌（1,067 mm軌間・三六軌間）

上記3社の共用（重複）区間。国鉄は貨物のみの運行だった（戦後、米軍の輸送を行った時期あり）。江若鉄道は1947年（昭和22年）から1965年（昭和40年）まで旅客列車を運行した。1969年（昭和44年）11月1日狭軌車両の運行廃止。廃止後も1976年（昭和51年）まで三本目の線路は残されていた。


九州水力電気（のちの西鉄福岡市内線）：今川橋駅 - 姪ノ浜駅

電車車両 = 標準軌

貨物列車 = 狭軌（914 mm軌間）

914 mm軌間の上記区間を1922年（大正11年）7月26日に1,435 mmに改軌・電化した際に、姪ノ浜駅以西の区間（ - 加布里駅）との間で貨車を直通させるために三線としたもの。1928年（昭和3年）6月1日に姪ノ浜以西が廃止となり、914 mmの線路は撤去された。


大阪電気軌道（現・近畿日本鉄道）吉野線：（旧）橿原神宮前駅 - 久米寺駅

久米寺駅は現・橿原神宮前駅付近。

大阪電気軌道畝傍線（現・近鉄橿原線）車両 = 標準軌