アベンジャーズのタイムトラベル先の2012年のニューヨークの戦いでロキが“テッセラクト”を手中に逃亡し、とある砂漠に転送された。だが、複数のマルチバースを監視し、時系列を乱す危険性の高い存在を排除する組織である時間変異取締局(Time Variance Authority
、通称TVA)のメンバーに拘束され、その本部へ連行される。そこでロキはTVAの職員であるラヴォーナとメビウス・M・メビウスに、神聖時間軸と呼ばれる時間軸が枝分かれしたことによりあらゆるマルチバースが誕生し、大変なことになっていることを説明され、彼らと共に神聖時間軸を正すべく活動することになる。しかし、TVAには目的とは別の大きな陰謀があったのだった。