1987年8月17日、93歳のヘスはシュパンダウ刑務所内の庭に設けられていた避暑用のキャビンにおいて電気コードで首を吊り死亡した。ヘスは以前にも二度自殺を試みていた。ポケットには遺書が残されており、鬱病による首吊り自殺と結論づけられた[86]。しかし、彼の死は自殺ではなく謀殺であり、遺書も偽造されたものだという主張も存在する。ヘスの息子ヴォルフ＝リュディガー・ヘス（ドイツ語版）はイギリスによる暗殺説を主張している。彼は「1980年代にはソ連が釈放に傾きつつあったため、単独飛行の際に話し合われたことを釈放後に暴露されることを恐れたイギリスが父を暗殺した」と主張している[87]。最後の囚人であった彼の死をもってシュパンダウ刑務所は閉鎖された。

葬儀には支持者などが殺到したため埋葬は延期され、その後秘密裏に行われた。毎年命日になるとネオナチがヘスの墓のあるヴンジーデルで集会を開いていた[82][88]。墓地の管理人とヘスの親族、ルーテル教会関係者はヘスの墓石を撤去することで合意し、2011年7月20日の深夜にヘスの墓は撤去された。ヘスの遺骨は火葬され、その灰は7月21日未明に海上に散布された[89][90]。ドイツのユダヤ人コミュニティ代表やホロコースト生存者の団体はこの対応を歓迎する声明を出した。ネオナチは30日に抗議集会を開いたり（250人が参加し、ナイフを持っていた数人が拘束された）教会関係者らに対し200通の脅迫状が送られてきた。極右思想の持ち主が実行犯であったノルウェー連続テロ事件に関連し巡礼地化する恐れも考慮された[91]。
その他

ヒトラーやヒムラーと同様に菜食主義者で、人智学を提唱した神秘家ルドルフ・シュタイナーの熱心な信奉者だった（ただし、ナチスはシュタイナーを敵視し攻撃していた）。シュタイナーの唱えた自然食とホメオパシーを忠実に行い、シュタイナーが晩年唱えたバイオダイナミック農法に強い関心を持っており、同農法のナチス党内での最大の擁護者であった[92]。
替え玉説

イギリスの歴史作家ヒュー・トマス（『スペイン市民戦争』などの著書があるイギリスの歴史家ヒュー・トマスとは別人）は1941年5月10日以降のヘスは本人ではなく替え玉だという説を提唱した。本物のヘスはイギリスに到着する前にヘルマン・ゲーリングの陰謀で撃墜されたことになっている[93][94][95]。
栄典
軍階級

1915年4月21日、一等兵（Gefreiter）

1915年5月21日、伍長（Unteroffizier）

1916年4月12日、副曹長（Vizefeldwebel

1917年10月8日、予備役少尉（Leutnant der Reserve）[96]

親衛隊階級

1931年12月18日、親衛隊上級大佐（SS-Oberfuhrer）

1932年12月5日、親衛隊中将（SS-Gruppenfuhrer）

1933年4月21日、親衛隊大将（SS-Obergruppenfuhrer）[96]

勲章

1914年版二級鉄十字章（1915年4月21日）

バイエルン戦功十字章（英語版）三級（1915年10月22日）

プロイセン航空名誉章

戦傷章銀章（1918年7月）

1929年ニュルンベルク党大会章（1929年）

コーブルク闘争名誉章（1932年）

1933年全国党大会記念章（1933年）

血盟勲章（1933年11月9日）

黄金党員名誉章（1933年）

親衛隊名誉リング（1933年）

古参闘士名誉章（1934年）

前線戦士名誉十字章（1934年）

1931年ブラウンシュヴァイク突撃隊集会記念章（1934年）

党勤続章

勤続10年銅章（1939年）

勤続15年銀章（1939年）

勤続25年金章（1941年?）[96]


パイロット章

脚注[脚注の使い方]
注釈^ アウシュヴィッツ＝ビルケナウ強制収容所所長を務めた親衛隊中佐ルドルフ・フェルディナント・ヘス (Rudolf Ferdinand Hos) とは別人。両者を区別するために、ルドルフ・フェルディナント・ヘスの方をルドルフ・ヘースと表記することもある。
^ ヘスはアビトゥーアに合格していないが、出征した者はアビトゥーアに合格していなくても入学が認められていた[16]。