クラフト＝エビングは進化論者の理論を更に進め、同性愛を、人間の胚及び胎児における懐胎期間の間に展開し、大脳の「性的反転」へと進展する異常過程と見なした。但し後年の1901年に彼は、『性的中間段階の年報』（Jahrbuch fur sexuelle Zwischenstufen）に発表した論文で自説を改め、「異常」（英語：anomaly）という用語を「変異」（英語：differentiation）に変更した。
同性愛の学説のその後

しかし、クラフト＝エビングの最終結論は、長い間忘れられた。その理由の一つは、ジークムント・フロイトの理論（精神分析）が同性愛を「心理学的な問題」と見なす人々（これが当時の主流見解であった）の関心を引き寄せたためであり、もう一つにはクラフト＝エビングが神聖性（sanctity）と殉教への志向をヒステリーやマゾヒズムと関連付けた（加えて彼が同性愛の邪悪さや倒錯性を否定した）ことで、オーストリアのカトリック教会の敵意を買ったためである。

後になってクラフト＝エビングの理論は、心の研究の専門家たちを導いて同じ結論に到達させ、また精神医学や心理学によるよりも、むしろ外科手術によって修正可能な別の性的変異（differentiation）としてのトランスジェンダーやトランスセクシュアルの研究へと導いた。

現代の精神医学は、同性愛を精神病理とは見なしていないことに注意すべきである（このような見方は、クラフト＝エビングが最初に提唱したものであった）。近代精神医学や近代精神分析学が登場して以降、人間の性愛や性行動の類型化が始まり、同性愛も異常性愛に分類された。それまでキリスト教圏では宗教的理由で同性愛を罪としてきたが、近代以降は、医学的にも異常とされ差別された。日本では元々同性愛を罪や異常とみなす考えはなかったが、近代以降、キリスト教と西欧精神医学の流入で、急速に異端視されるようになる。そのような精神医学界に医学的立場から最初に異を唱えたのはクラフト＝エビングであり、後年は、同性愛者らの運動もあり、同性愛は異常性愛から完全に除外された。
「性の精神病理」に関する逸話

この本は、著者の在世中に12版を重ねた。

初版は110頁の薄い本であったが、増補を重ねた12版は434頁の大著となっている。性倒錯の体系化は版を追ってなされ、フェティシズムが登場するのは第4版から、サディズムとマゾヒズムが本格的に扱われるのは第6版からである。

第2版では、一部がラテン語で記された。学術的な目的とはほど遠い（と推定される）一般人による本の需要が多かったためである。

日本では明治時代に出版されたが、発禁扱いだった。1913年（大正2年）『変態性慾心理』の名で紹介され、これが大正デモクラシーの開放的な風潮と重なって起きた変態性欲ブームに影響を与えた。「変態」の俗語が生まれたのはこの時からであると見なされている。

この本は、クリトリス・オルガスムスの重要性や、女性の性的快楽、性犯罪者の行為を判断する場合の精神状態への配慮など、性に関する問題を、丹精を込めた方法で研究した最初の書籍の一つであると共に、同性愛についての最初の科学的な議論が行われた書籍である。

何十年にもわたり、性的逸脱に関する権威であり、また疑いなくジークムント・フロイト以前において人間の性に関する最も影響力ある書籍の一つであった。

著者クラフト＝エビングは、この本によって称賛と断罪を受けた。待望されていた心理学の新しい研究領域に幕開けをもたらしたことで称賛され、性倒錯を正当化したことや不道徳性で非難された。

主著

Psychopathia Sexualis 初版:1886年／Bloat Booksによるリプリント版:1999年 ISBN 0-9650324-1-8

日本語訳

『色情狂編』 日本法医学会/春陽堂　1894年（明治27年）明治政府により発禁処分

『変態性欲心理』 大日本文明教会 1913年（大正2年）

『変態性慾心理』 松戸淳訳 紫書房 世界艶笑文庫 1951年 (昭和26年)

『変態性欲心理学』 性問題研究会編 河出書房 1956年（昭和31年）

『性愛心理』 平野威馬雄訳 学藝書林 1971年（昭和46年）

『クラフト＝エビング変態性慾ノ心理』 柳下毅一郎訳 原書房 2002年（平成14年）ASIN 4562035285

『変態性欲心理―変態性欲と近代社会〈1〉』斎藤光編 ゆまに書房 2006年（平成18年）ISBN 4-8433-2144-3


その他の著作

クラフト＝エビングは多数の著書を残した。以下はその一部である。

Die Melancholie: Eine klinische Studie （メランコリー：臨床的研究） （1874年）

Grundzuge der Kriminalpsychologie fur Juristen （法律家のための犯罪心理学の基礎特徴） （第2版：1882年）

Die progressive allgemeine Paralyse （一般進行性麻痺症） （1894年）

Nervositat und neurasthenische Zustande （神経過敏と神経衰弱状態） （1895年）

4冊の著書がクラドック（Craddock）によって英訳されている。

An Experimental Study in the Domain of Hypnotism （催眠状態領域の実験的研究）』 （New York and London： 1889年）