『トランスフォーマー』シリーズ第3作『トランスフォーマー/ダークサイド・ムーン』では降板したが、第2作『トランスフォーマー/リベンジ』公開時のインタビューで、マイケル・ベイ監督について「ナポレオンみたい。撮影中クレイジーでひどいの。まるでヒトラーよ。っていうかヒトラーそのものね！」とコメントしたことが、ユダヤ系アメリカ人であるスティーヴン・スピルバーグ（製作総指揮）の逆鱗に触れ、キャスト変更を命じたためといわれている。なお、ベイ監督自身は「ミーガンの言うことだから」とコメントについて気にしていないと話し、「映画の現場は彼女が考えるほど甘いものではない」という趣旨の諭すようなコメントを出していた[30][31]。
身体

身長については168cmとしているソースが多く見られるものの、元夫のブライアン・オースティン・グリーンと並んだ際に頭部がちょうど肩のあたりに位置していることなどから、実寸は163cmほどであると見積もられ、体重は52kgほどとされている（2011年）[32]。強迫性障害であることを告白している[33]。
タトゥー2007年

タトゥーマニアであり、計8つのタトゥーを入れている[34]。右側付近に夫ブライアンの名前、右腕にマリリン・モンローの顔[35]、背中の右側にウィリアム・シェークスピアの『リア王』の一節「We will all laugh at gilded butterflies」「there once was a little girl who never knew love until a boy broke her HEART」と漢字で「力」[36]、右手首の内側に太極図、足首より上の下脚の内側に5つの尖った星が重なっている三日月（彼女のタトゥーの中で唯一の色つき）などがある。太極図のタトゥーは消すつもりだと述べていたが、現在も残されている[37]。

2009年5月にジョン・F・ケネディ国際空港でパパラッチに新たなタトゥーを入れるつもりだと明かした[38]。しかし、母親ダーレンはこれに反対し「ミーガンが40歳になって熟年の役を演じたくなった時に、タトゥーをカバーするのが大変だという理由で役がもらえなくなると思っている」と伝えられている[39]。

2009年6月に出演したテレビ番組『The Early Show』の中で自分の恋人となる条件にタトゥーがあることを挙げている[40]。

私生活

2004年のテレビ番組共演をきっかけに俳優のブライアン・オースティン・グリーンと交際に発展し、2006年11月に婚約した[41]が、2009年2月婚約解消を発表[42]。婚約解消後も交際は続け、2010年6月に再び婚約を発表。同年6月24日にハワイ島で極秘で結婚式を挙げた[43]。2012年に第1子となる男児を出産[44]。2014年に第2子となる男児を出産している[45]。また、2016年には第3子となる男児を出産した[46]。2020年5月、グリーンが別居を発表[47]。