2010年、次回作として『夢見る機械』の制作に着手していた今敏が膵癌により同年8月24日に46歳で死去。同年9月10日には日本振興銀行が経営破綻、振興銀と融資や債権購入などで繋がりが深かった親会社のインデックスは大きな経済的損失を被り、その余波がインデックスグループ各社にも波及する。マッドハウス自身も二期連続で赤字に追い込まれるなど、苦しい出来事が続いた。

2011年2月8日、日本テレビ放送網により子会社化が発表され、同月18日に実施された[4]。これにより、マッドハウスが同日付けで実施する第三者割当増資の全額約10億円を日本テレビ放送網が引き受け、インデックスに代わって所有株式割合84.5%の筆頭株主となった。同時に日本テレビ放送網出身の岡田浩行が社長に就任した。有限会社マッドボックスについても2012年3月に株式会社に登記変更し、日本テレビ放送網のグループ企業となった。日本のアニメ制作産業ならびに制作会社の経済力の弱さと低迷が指摘されており、マッドハウスは日本テレビ放送網が持つコンテンツ管理能力のノウハウの導入を受けて、経営を改善し立て直しを目指すこととなった。

上記の経緯を受け、2011年以降しばらくは日本テレビ系列で放送する深夜アニメを多数制作していたが、2015年9月『俺物語!!』の終了以降、再び他系列局で放送する作品が多数を占めるようになった。

近年では、漫画や小説のアニメ化とオリジナル作品を平行して制作し、他社との共同制作も行っている。

アニメーター育成のため研修制度「マッドハウス 動画訓練所」により人材確保を行っている[5]。
不祥事
過酷な労働環境と残業代未払いによる労働基準監督署からの是正勧告
2019年4月17日に労使協定で定めた上限を超える長時間労働させていたことに加え、残業代も未払いだった[6]として新宿労働基準監督署から是正勧告を受けた[7]。労基署に申告した社員によると1か月の労働時間が393時間になることもあり[7]、過酷な労働環境から帰宅途中に倒れて緊急搬送されることもあった[8]。また、制作現場ではパワハラも発生していた[9]。社員はその後の団体交渉でこうした労働現場の改善を要求したが、すべて会社から拒否された[7]。
作品
テレビアニメ
1970年代 - 1990年代

開始年放送期間タイトル監督アニメーション
プロデューサー備考
1979年4月 - 1980年4月アニメーション紀行 マルコ・ポーロの冒険藤田克彦
松村浩志
村上憲一
中村哲志
酒井和行N/A
1989年7月 - 1990年1月EASY COOKING ANIMATION セイシュンの食卓平田敏夫制作協力:キティ・フィルム
10月 - 1992年9月YAWARA!ときたひろこ丸山正雄製作:キティ・フィルム
1994年10月 - 12月D・N・A2 ?何処かで失くしたあいつのアイツ?坂田純一長谷川洋
丸山正雄共同制作:スタジオディーン
1995年4月 - 1998年3月あずきちゃん小島正幸吉本聡
1998年2月 - 1999年1月Bビーダマン爆外伝中西伸彰
4月 - 9月TRIGUN西村聡諸澤昌男
4月 - 12月カードキャプターさくら浅香守生小野達矢
10月 - 1999年3月MASTERキートン小島正幸吉本聡
10月 - 1999年9月スーパードール★リカちゃん杉井ギサブロー丸山正雄制作協力:スタジオジュニオ→SSJ
1999年2月 - 2000年1月Bビーダマン爆外伝V川瀬敏文白井勝也制作協力:スタジオジュニオ[注釈 2]
3月Petshop of Horrors平田敏夫諸澤昌男
4月 - 6月十兵衛ちゃん -ラブリー眼帯の秘密-大地丙太郎（総）
桜井弘明小池経利
諸澤昌男
カードキャプターさくら（第2期）浅香守生小野達矢
7月 - 10月魔法使いTai!佐藤順一浅利義美
安部正次郎
9月 - 2000年3月カードキャプターさくら さくらカード編浅香守生小野達矢
11月 - 12月Di Gi Charat デ・ジ・キャラット桜井弘明諸澤昌男

2000年代

開始年放送期間タイトル監督アニメーション
プロデューサー備考
2000年1月 - 3月ブギーポップは笑わない Boogiepop Phantom渡部高志浅利義美
安部正次郎制作協力:トライアングルスタッフ
1月 - 4月風まかせ月影蘭大地丙太郎諸澤昌男
4月 - 9月陽だまりの樹杉井ギサブロー小野亮