他の問題としては、スタジオがコスト削減のためにパリのシーンをモントリオールかプラハで代用しようとしたこと、リーマンがフランス語を話す撮影スタッフにこだわったこと、パリのシーンの結末について試写の反応が悪かったことなどが挙げられる。後者の問題に対しては、パリのストーリーをよりアクション重視の新しい結末にするため、再度ロケに出る必要が生じた[13]。撮影はパリのほか、プラハ、インペリア、ローマ、ミコノス、チューリッヒで行われ、チューリッヒのいくつかのシーンはプラハでも撮影された[4]。デイモンは、彼とリーマンがスタジオと抱えた初期の対立を引き合いに出して、製作が苦労の連続だったと述べたが、極端に困難ではなかったとし、「製作が悪夢だったという話を聞くと、どれほど『悪夢』なのかと思ってしまうが、撮影は常に困難なものだし、我々はそれを完成させたんだ。」と述べている[14]。

リーマンの監督手法は、しばしば実践的であった。自分自身と素材と俳優の間に、より親密な関係を築きたいと考え、自らカメラを操作することも少なくなかった。モニターに映し出される映像をただ見ているだけでは、この関係は失われると考えたのだ。これは、小規模なインディーズ映画製作者としての経歴から培われた考え方であった[9]。

カーチェイスのシーンは、アレクサンダー・ウィットが率いるセカンド・ユニットが中心となって撮影し、高い評価を得た。リーマンがパリの別の場所で本編を撮影している間、このユニットはパリ周辺のさまざまな場所で撮影を行った。完成した映像は最終的に編集されて一連のアクションであるかのように見えるが、「パリを本当に知っている人なら誰でも矛盾に気づくだろう」とリーマンは述べた[13]。リーマンが自分で撮影したカーチェイスシーンは数カットだけで、その中で際立つのは車中のデイモンとポテンテのカットである[4]。

領事館のシーンは2001年に撮影され、本物のアメリカ海兵隊保安警護隊が領事館の警備役を演じた[15]。
作品の評価
映画批評家によるレビュー

Rotten Tomatoesでは、192のレビューに基づいて84％の支持率、7/10の平均スコアを得ており、「ボーン・アイデンティティーは、ジャンルの定石と予想外のウィットを巧みに融合させたアクションスリラーであり、さらにその上を行く作品です。」としている[16]。Metacriticは、38人の批評家に基づいて100点満点中68点の加重平均スコアとしており、「一般的に好評」を示している[17]。 CinemaScoreで投票した観客は、A+からFの間で平均「A-」を与えた。

シカゴ・サンタイムズ紙のロジャー・エバートは、この映画に4つ星のうち3つを与え、本作の「スパイ能力」と「デイモンの集中力と誠実さ」に観客を引き込む能力を賞賛し、この映画は「不必要だが、未熟ではない」と結論づけた[18]。 Film Freak Centralのウォルター・チャウは、この映画のテンポとアクションシーンを賞賛し、「運動的で、公平で、知的で、すべての結末は緊張を生み出すのに重要な一瞬の沈黙とパッケージされている」と述べ、この映画はこのジャンルに対する巧みな挑戦として理解できると述べている[19]。Salon.comのチャールズ・テイラーは、この映画を「娯楽的でハンサムで手に汗握る、『ボーン・アイデンティティー』は夏の大作映画の中では異例のものだ。スリラーに頭脳と感情があり、スペクタクルよりもストーリーとキャラクターに忠実だ」と賞賛し、リーマンがこの映画に「シニカルさや絶望」に陥ることのない「強靱な精神性」を与えている、と評価している[20]。