ボストンは世界でも有数のイノベーション都市である[97][98]。市内に本社を置く大企業としては、リバティ・ミューチャル保険会社、ジレット（現在はプロクター・アンド・ギャンブルが保有）などもある。半導体その他の電子試験用品の世界的メーカーであるテラダインは2006年に撤退した。ニューバランスも市内に本社を置く。経営コンサルタント会社のボストン・コンサルティング・グループ、モニター・グループ、ベイン・アンド・カンパニー、プライベート・エクイティ・グループであるベインキャピタルもある[99]。市外、特に州道128号線沿いにある大企業もある[100]。128号線は、この地域のハイテク産業の中心地としての役割を果たしている。2006年において、ボストンおよび同都市圏は、19万1700人のハイテク産業従事者を有し、全米第4のサイバーシティとしてランクされた。これを上回るハイテク部門を有するのは、ニューヨーク都市圏、ワシントンD.C.首都圏、シリコンバレーのみである[101]。ボストン港は、アメリカ合衆国東海岸の主要な港であるとともに、西半球で最も古くから運営を続ける工業港・漁港でもある[102]。ボストン海軍工廠は港の遺産である。
交通
空港

ローガン国際空港は、イーストボストン地区にあり、ボストンのほとんどの定期旅客便を取り扱っている[103]。また南北アメリカやアジア、ヨーロッパとの国際線が乗り入れている。

市を囲んで、ゼネラル・アビエーション（輸送事業以外の一般民間航空）の大きな飛行場が三つあり、北がベバリー市営飛行場、西がベッドフォードのハンスコム・フィールド、南がノーウッド・メモリアル飛行場である。ロードアイランド州プロビデンスのT・F・グリーン空港と、ニューハンプシャー州マンチェスターのマンチェスター・ボストン地域空港も、ボストン圏に定期旅客便を提供している。
鉄道サウス・ステーション（ボストン南駅）。大ボストン都市圏の中では最大の鉄道駅・バスターミナルである。

ボストン市民の3分の1近くが、通勤に公共交通機関を使っている[104]。アメリカ最初の地下鉄網であるマサチューセッツ湾交通局（MBTA）の地下鉄を運営が運営されており、これは現在全米で4番目に繁忙な地下鉄であり[9]、線路の全長は105kmにまで延伸し[105]、北はモールデン、南はブレイントリー、西はニュートンにおよぶ。この地下鉄網は「T」という愛称で呼ばれている。交通局はこれ以外に、繁忙度全米第6位のバス網（MBTA Bus）のほか、水上往復便、そして繁忙度全米第5位のコミューター・レールも運営している。コミューター・レールは、営業距離321km超[105]、北はメリマック・バレー、西はワーススター、南はプロビデンスまで伸びる。

長距離旅客列車を運行するアムトラックのターミナル駅は路線によってサウス・ステーション（ボストン南駅）とノース・ステーション（ボストン北駅）の2箇所に分かれている。北東回廊とシカゴ・ラインは、ボストンのサウス・ステーション（ボストン南駅）から出発し、バックベイ駅で停車する。北東回廊の列車はニューヨーク、ワシントンD.C.およびその間のいくつかの駅に停車し、ボストン南西郊外のルート128駅にも停車する[106]。また、メイン州に向かうアムトラックのダウンイースターはノース・ステーション（ボストン北駅）から出ている[107]。