イスラーム帝国の支配下でも、ベルベル人は優秀な戦士として重用された。711年にアンダルス（イベリア半島）に派遣されてグアダレーテ河畔の戦いで西ゴート王国を滅ぼしたイスラム軍の多くはイスラムに改宗したベルベル人からなっており、その司令官であるターリク・イブン=ズィヤードは解放奴隷出身でムーサーに仕えるマワーリー（被保護者）であった。ベルベル人は征服されたアンダルスにおいて、軍人や下級官吏としてアラブ人とロマンス語話者のイベリア人との間に立った。彼らは数的にはアラブ人より多く、イベリア人より少なかった。

マグリブとアンダルスでのベルベル革命（英語版）（739年 - 743年）、750年のアッバース革命の後、756年のムサラの戦い（スペイン語版、カタルーニャ語版）で後ウマイヤ朝（756年 - 1031年）が成立。

イブラーヒーム・イブン・アル・アグラブ（英語版）がイフリーキヤで自立しアグラブ朝（800年 - 909年）を興した。ウバイドゥッラーがアグラブ朝を倒し、ファーティマ朝（909年 - 1171年）を興すと、ベルベル人はその支配下でズィール朝（983年 - 1148年）を興した。ズィール朝にアルジェが建設された。
タイファ期

11世紀、12世紀のタイファ期には、イスラム化して以降熱心なムスリム（イスラム教徒）になっていたベルベル人は、モロッコでイスラムの改革思想を奉じる宗教的情熱に支えられたベルベル人の運動から発展した国家、ムラービト朝（1040年 - 1147年）、ムワッヒド朝（1130年 - 1269年）を相次いで興した。ベルベル人が他民族を支配した数少ない王朝であったムラービト朝やムワッヒド朝でも、王朝の公用語はムスリムである以上アラビア語であり、ベルベル語ではなかった。

ベルベル人もイベリア半島に侵入し、アンダルスに入った。ベルベル人が樹立した征服王朝のナスル朝グラナダ王国（1232年 - 1492年）の時代、支配下の人民の多くがロマンス語やベルベル語の影響を受けたアル・アンダルス＝アラビア語を用いていたとされる。ベルベル人は当初、支配者はより一層アラブ化してアラビア語を話すようになり、下位の者は民衆に同化してロマンス語を話すようになった。しかし年月がたち、改宗によってムスリム支配下の南部イベリアにおけるムスリムの全人口に占める割合が増加するにつれ、アラビア語の圧力はさらに高まり、ベルベル語話者やロマンス語話者の多くが民衆アラビア語に同化していった。時とともにベルベル人・アラブ人・イベリア人の三者は遺伝的・文化的に入り混じっていき、現在のスペイン語にはアラビア語とともにベルベル語の影響が見られる。またベルベル人の遺伝子もスペイン人やポルトガル人の遺伝子プールに影響を与えた。

ムワッヒド朝はアンダルスでのキリスト教徒との戦いに敗れて衰退、滅亡し、代わってモロッコ地域にはマリーン朝、チュニジア地域にはハフス朝というベルベル人王朝が興隆した。マリーン朝はキリスト教徒の侵入に抵抗するグラナダ王国などのイスラーム勢力を支援し、イベリアのキリスト教勢力と激しい戦いを行ったが、アルジェリア地域のベルベル人王朝であるザイヤーン朝との戦いにより国力を一時失い、それに乗じたカスティーリャ王国により1340年にはチュニスが占領された。しかしスルタンであるアブー・アルハサン・アリーにより王朝は一時的に持ち直し、1347年にはチュニスを奪回した。しかしマリーン朝の復興は長く続かず、アブー・アルハサンの次のスルタンであるアブー・イナーン・ファーリスの死後は再び有力者同士の内紛で衰亡し、ポルトガル王国により地中海や大西洋沿岸の諸都市を占領された。マリーン朝は最終的に15世紀の半ばに崩壊し、以後モロッコ地域は神秘主義教団の長や地方の部族が割拠する状態になった。
モリスコ追放

1492年にナスル朝が滅亡すると、イベリアに居住していたベルベル系のムスリムは、アラブ系やイベリア系のムスリムとともにモリスコとされた。モリスコは当初一定程度の人権を保障されていたが、やがてキリスト教への強制改宗によりイベリア人のキリスト教社会に同化させられ、それを拒む者はマグレブへと追放された（モリスコ追放）。現在でもマグレブではこの時代にスペインから追放された人々の子孫が存在している。