メガトロン率いる悪のトランスフォーマー軍団。今回のディセプティコン部隊は月に潜伏しており、先んじてアークからスペースブリッジの連結装置である「柱」の大半を回収、自分たちと結託したセンチネルがそれらを起動したことを切っ掛けに地球へ艦隊と大部隊を送り込み総攻撃を仕掛ける。また、かねてから宇宙開発事業に関わる人間を脅迫したり協力者として引き込んでは自分たちが月で活動していたことを隠蔽させ、さらに彼等を通じてアメリカ政府に圧力を掛けてこれ以上の月面調査を中止させていた。決まった規格によって生み出されているため同型の別個体が複数体存在する（コミック前日譚のブレインズの台詞が示唆）。
航空宇宙司令官スタースクリーム / Starscream
声 - チャーリー・アドラー / 吹き替え - 宮澤正IDナンバー - DD-02タトゥー模様入りロッキード・マーティン・F-22ラプターに変形。今作では、強者にはゴマを擂って媚を売り、弱者をいたぶる卑劣漢としての面が強調されている。IDWコミックでセンチネルの支配を認めず、アークへの攻撃指揮を執る様子が描かれた。シカゴ戦にてNESTのVTOL輸送機を撃墜。エップスたちとはぐれたサムに目を付けて嬲り殺しにしようと目論むが、中盤にカーリーを人質にとられ、不本意ながらディセプティコンに協力させられた件を利用して愚弄したことで、それによって憤怒したサムの反撃を受け、キューが開発したグローブのアンカーで右目を潰されパニックに陥り、増援に駆け付けたNEST部隊の集中砲火を受ける。さらに残った左目にボムスティックを突き立てられて頭部が爆裂、死亡した。
情報参謀サウンドウェーブ / Soundwave
声 - フランク・ウェルカー / 吹き替え - 斉藤次郎IDナンバー - DD-13地球上に降下し、シルバーのメルセデス・ベンツ・SLS・AMGをスキャン。主に諜報活動を行い実質的にメガトロンの右腕である。武装は2丁拳銃。顔は目と口が露出している。メガトロンやスタースクリームの腰の辺りまでの背丈しかない。他のディセプティコンたちに先んじて地球に到達・潜伏し、ディランの父たちに接触して月面探査計画を中止させた張本人。ディランによってカーリーにプレゼントされる形で彼女たちに近づき、中盤でディセプティコンの協力者としての顔を見せたディランの指示を受けて彼女を捕縛。