なお、ヴァンダル・サベッジのいう「ユーバーメンシュ」は、『ヤングオールスターズ』に登場するヴィランで、ナチスドイツ側のヒーローである[21]。 ヴィランのチームも参照。
ヴィラン（悪役）
アリシア
声 - 杉本ゆう/英 - ジュリー・ボーウェンワンダーウーマンの幼馴染み。元はセミッシラの外の人間で、テロリストの襲撃で親を失いセミッシラまで漂流してきた。自身の境遇を生んだ原因として、男という存在そのものを憎んでいる。第16話・第17話「憎しみ」に登場。
ヴァンダル・サベッジ[22]
声 - 秋元羊介（シーズン1）→沢木郁也（シーズン2）/英 - フィル・モリス時を越えて第二次世界大戦に介入し、歴史の改変を企む謎の男（第24話?第26話）。2万5千年（原作では5万年前で、グリーンランタンの敵[23]）に落ちた隕石からのパワーを受け不老不死となった（第33話・第34話）。スーパーマンの死後、重力コントロール装置を使い、世界征服に乗り出した。リーグを全滅させたものの、太陽系の重力バランスを狂わせてしまい、地球の環境が激変、人類は滅亡した。その後、不死身の彼は一人で何千年も生き続けた（第45話・第46話）。
ウルトラ・ヒューマナイト
声 - 北川勝博/英 - イアン・ブキャナン自らの頭脳を白いゴリラに移植した科学者。レックスの隣の独房に収監されていた。オペラなどを愛好する。第8話・第9話「正義を脅かす陰謀」、第49話「英雄たちのクリスマス」に登場。
クレイフェイス
声 - 上田陽司/英 - ロン・パールマンドラム缶状の容器に密封され、保管されていた。大富豪がその状態でコレクションしていたが、グロッド率いるシークレット・ソサエティに救出され、メンバーになった。第44話「シークレット・ソサエティ PART 2」に登場。オリジンは語られていないため、（原作での）何代目に当たるかは不明。
グロッド
声 - 木村雅史/ 英 - パワーズ・ブースアフリカにあるゴリラシティに住む、ゴリラの科学者。第14話・第15話「知られざる街の危機」、第43話・第44話「シークレット・ソサエティ」に登場。なお、ゴリラシティに住むゴリラたちは、人間（地球人）程度の知能・感情を有している。
ジョーカー
声 - 青野武/英 - マーク・ハミルバットマンの宿敵。完全な異常者で殺人道化師。第8話・第9話「正義を脅かす陰謀」、第47話・第48話「ワイルド・カード」に登場。
ソロモン・グランディ
声 - 上田陽司、隈本吉成（16話のみ）/英 - マーク・ハミル→ブルース・ティムその名を19世紀の子守唄に因む怪人。怪力の持ち主であるが知能は低い。第8話・第9話「正義を脅かす陰謀」、第16話・第17話「憎しみ」、第31話「悪夢 PART 1」に登場。第41話・第42話「異世界からの驚異」ではリーグと共闘した。
ダークサイド
声 - 野中秀哲/英 - マイケル・アイアンサイドスーパーマンの宿敵。惑星アポコリプスの独裁者。ニュー・ジェネシスとも敵対関係にある。第27話・第28話「正義の夜明け」に登場。前作で何度も地球に魔の手を伸ばしてきた。非常に強力で、スーパーマンと正面から殴りあえる数少ない存在。腕力・耐久力は、基本的にスーパーマンを上回っている。目からは「オメガビーム」を放出でき、スーパーマンのヒートビジョンと違い、任意に曲げられる。前作ではスーパーマンを捕らえて洗脳し、自分を父親だと思い込ませ、地球侵略の尖兵としたこともあった。そのため、本作でリーグに助力を申し出た際、スーパーマンに冷淡な対応をされている。
ドクター・ディスティニー
本名：ジョン・ディー。元は普通の人間だったが、服役中に超能力開発マシンの披見体となり、独断でマシンのパワーを増幅させたため、悪夢を操る能力を得た。再婚した元妻に悪夢を見せて殺害、ターゲットをリーグに移す。スーパーマン、グリーンランタン、フラッシュ、ホークガールを悪夢に落とし込むが、ジョン・ジョーンズにより次々に奪回された（ワンダーウーマンは未登場）。同時進行でバットマンが本体に近づいたため、最終的には薬物投与までして能力増強を図ったが敗れ、正気を失い病院に収容された。第31話・第32話「悪夢」に登場。
バトルワールド（惑星）の関係者
第12話・第13話「戦闘の星」に登場。
ドレーガ
声 - 立木文彦/英 - ウィリアム・スミスバトルワールドのチャンピオン。
モングル（英語版
声 - 中多和宏/英 - エリック・ロバーツバトルワールドの支配者。
ブレイニアック