ブラックブライアー作戦の関係者を失脚させた後、地下格闘技の世界で生計を立てていたボーンの元へ、ハッキングによって新たに探り当てた事実を告げに元CIA局員のニッキーが現れる。事態の露見を恐れたCIA局長の放った刺客がボーンとニッキーを襲い、ニッキーは殺害されてしまう。ボーンはニッキーの遺した情報を元に、全容を解明するために再び動き出す。
CIA局員のヘザーはボーンがまだ愛国心をもっているとし、ボーンをCIAに引き戻すことを局長を含めた上層部に提案して受け入れられる。ボーンは元局員のマルコムを追い詰め、ボーンの父親がトレッドストーン計画を作ったが、息子のボーンが参加者となることを知り、息子を守るためにトレッドストーン計画の暴露を示唆したことから殺されたことを知る。
ヘザーはボーンにCIA局長の新しい計画であるアイアンハンドの存在を明らかにする。ディープドリーム社のシンポジウムにてヘザーはボーンと協調行動をとり、局長の刺客はディープドリーム社CEOを暗殺しようとするが、ボーンにより未遂に終わる。ボーンはCIA局長と対峙する。32人を暗殺し、アメリカは平和になった、CIAに戻って来いと局長は言い、ボーンはできないと答える。直後、飛び込んできた護衛の協力によりCIA局長にボーンは殺されそうになる。そこにヘザーが現れ、局長を射殺する。ボーンは自分が殺したことにすることをヘザーに示唆する。残った刺客は警察車両を奪い逃走、ボーンも車を盗み後を追う。そして一般市民を巻き込みラスベガスの街を破壊するカーチェイスの後、ボーンは刺客と直接戦うがボーンが刺客を殺害し勝利する。
ヘザーはCIAに戻ることをボーンに勧めるが、ボーンは考えてみるとだけ答える。ヘザーが車に戻ると、ヘザーがボーンをCIAに引き戻すことに失敗した場合は、ボーンを始末する必要があるとヘザーが上層部に明言していることが録音されている再生機がボーンによって置かれている。ヘザーはボーンにしてやられたのであった。
登場人物・キャスト
ジェイソン・ボーン - マット・デイモン
地下格闘技で生計を立てている。
ロバート・デューイ- トミー・リー・ジョーンズ
CIA長官。
ヘザー・リー - アリシア・ヴィキャンデル
CIAのハッカー。
アセット - ヴァンサン・カッセル
作戦員。
ニッキー・パーソンズ - ジュリア・スタイルズ
ボーンのかつての協力者。
アーロン・カルーア - リズ・アーメッド
ディープドリーム社CEO。
クレイグ・ジェファーズ - アトー・エッサンドー
役名俳優日本語吹替
ソフト版[4]BSテレ東版[5][6]
ジェイソン・ボーンマット・デイモン平田広明三木眞一郎
ロバート・デューイCIA長官トミー・リー・ジョーンズ土師孝也大塚明夫
ヘザー・リーアリシア・ヴィキャンデル竹内絢子甲斐田裕子
アセット(作戦員)ヴァンサン・カッセル向井修山路和弘
ニッキー・パーソンズジュリア・スタイルズ沢海陽子百々麻子
アーロン・カルーアリズ・アーメッド川田紳司浪川大輔
クレイグ・ジェファーズアトー・エッサンドー