『ボーン・レガシー』は2012年8月10日に米国で公開され[19]、ジェレミー・レナーが主人公のアーロン・クロスを演じた。

『レガシー』への批評家の反応は賛否両論に終わったが、ユニバーサルはロサンゼルスでの会見で更なる続編の計画を明かした[20]。2012年12月デイモンはインタビューで自身とグリーングラスがジェイソン・ボーン役と監督復帰に関心があることを明かした[21]。2013年11月8日、『Deadline.com』は5作目ではレナーのクロスが登場し、ジャスティン・リンが監督する予定であると報じた[22]。脚本はアンドリュー・ボールドウィンが執筆し、2016年7月16日公開の予定が組まれた[23]。

2014年9月15日、デイモンとグリーングラスが次回の『ボーン』に復帰し、レナーはそれとは別の映画でクロス役を続投すると発表された[24]。2014年11月、デイモンは自身とグリーングラスは編集技師のクリストファー・ラウズと共同で執筆した脚本により復帰することを明かした[25][26]。2015年5月23日、『Deadline.com』はアリシア・ヴィキャンデルが5作目でのデイモンとの共演交渉中であると報じた[27]。2015年6月19日、『Deadline』は初期3作品でニッキー・パーソンズを演じたジュリア・スタイルズが同役で出演することを報じた[28]。またヴィゴ・モーテンセンへの悪役での出演交渉が行われた[29]。2015年6月23日、ヴィキャンデルは同じく交渉中であった『アサシン クリード』を断って『ボーン』への出演を決めたことが報じられた[30]。2015年7月28日、トミー・リー・ジョーンズがCIA高官を演じるためにキャストに加わった[31]。2015年9月1日、ヴァンサン・カッセルがボーンを追跡する悪役の暗殺者を演じるためにキャストに加わった[32]。2015年9月15日、『ハリウッド・リポーター』はアトー・エッサンドー（英語版）が役名不詳のキャラクターでキャストに加わったことを報じた[33]。2015年10月20日、スコット・シェパード（英語版）がCIA副長官役でキャストに加わった[34]。2015年11月4日、『バラエティ』はリズ・アーメッドがCIAの技術専門家役で契約したことを報じた[35]。
撮影ベルリンでの撮影。

2015年8月、製作者たちはネバダ州クラーク郡当局と会談し、ストリップで撮影するために7日ないし10日のあいだ1日につき数時間のラスベガス・ブルバード（英語版）封鎖を求めた。この件に関して製作側が許可を得たのかは定かでは無い。デイモンは映画が9月に製作が始まり、物語がギリシャ（実際にはカナリア諸島に属するテネリフェ島で撮影）で始まってラスベガスで終わり[36]、「スノーデン後の世界」のボーンになることを明かした[37][38]。

主要撮影は2015年9月8日に始まった[39]。11月上旬にはイングランドロンドンのパディントン駅の外で撮影された[40]。11月末、ベルリンのクロイツベルク（英語版）で撮影が行われた[41]。12月上旬、ワシントンD.C.での撮影が始まり、コンスティテューション・ガーデンズ（英語版）で撮られた[42]。