2015年5月8日、日本年金機構のパソコンのウイルス感染が確認された際に、情報端末の異常に気付き、機構側に通報した。だが、通報を受けた機構側の対応がずさんだったため、被害が拡大し、約125万件の情報が流出する結果となった[5]（詳しくは、年金管理システムサイバー攻撃問題参照）。
2023年8月4日、内閣サイバーセキュリティセンター（NISC）は電子メール関連システムが不正アクセスを受け、メールアドレスや文面などメールデータの一部が漏えいした可能性があると発表した。[6] 内閣官房組織令（昭和32年政令第219号）第4条の2に定める所掌事務は以下のとおりである。 内閣官房組織令（昭和32年政令第219号）のほか、内閣サイバーセキュリティセンターに企画官等を置く規則（平成28年4月1日内閣総理大臣決定）[7]及び内閣サイバーセキュリティセンターに副センター長等を置く規則（平成28年3月31日内閣総理大臣決定）[8]に基づく。 「NISC組織体制」に基づく[9]
所掌事務
情報通信ネットワーク又は電磁的記録媒体（電子的方式、磁気的方式その他人の知覚によつては認識することができない方式で作られる記録であつて、電子計算機による情報処理の用に供されるものに係る記録媒体をいう。）を通じて行われる行政各部の情報システムに対する不正な活動の監視及び分析に関すること。
行政各部におけるサイバーセキュリティ（サイバーセキュリティ基本法（平成二十六年法律第百四号）第二条に規定するサイバーセキュリティをいう。以下この項において同じ。）の確保に支障を及ぼし、又は及ぼすおそれがある重大な事象の原因究明のための調査に関すること（内閣情報調査室においてつかさどるものを除く。）。
行政各部におけるサイバーセキュリティの確保に関し必要な助言、情報の提供その他の援助に関すること。
行政各部におけるサイバーセキュリティの確保に関し必要な監査に関すること。
前各号に掲げるもののほか、行政各部の施策に関するその統一保持上必要な企画及び立案並びに総合調整に関する事務のうちサイバーセキュリティの確保に関するもの（国家安全保障局、内閣広報室及び内閣情報調査室においてつかさどるものを除く。）。
組織
センター長（事態対処・危機管理担当内閣官房副長官補）
副センター長(2人以上)（内閣審議官から任命（うち1人は危機管理審議官））
上席サイバーセキュリティ分析官
サイバーセキュリティ運用専門官
上席情報システム専門官
情報システム専門官
企画官(2人)（専任）
企画官（併任）
サイバーセキュリティ監査官(6人)
サイバーセキュリティ参与（非常勤）
政策調査員
グループ
政策対応機能
基本戦略総括グループ
基本戦略第1グループ
基本戦略第2グループ
国際戦略グループ
政府機関総合対策グループ
重要インフラ第1グループ
対処調整機能
対処調整グループ
情報収集・対処機能
情報統括グループ
重要インフラ第2グループ
サイバー関連事業者グループ
情報集約・分析機能
分析集約統括グループ
技術解析グループ
調査分析グループ
脚注[脚注の使い方]
出典^ “内閣官房組織等英文名称一覧
^ “内閣官房情報セキュリティセンター
^ “ ⇒内閣サイバーセキュリティセンター（NISC）とは”. 内閣サイバーセキュリティセンター. 2015年1月17日閲覧。
^ JPCERT/CC、内閣官房内閣サイバーセキュリティセンターと国際連携活動 及び情報共有等に関するパートナーシップを締結
^ “年金情報流出：時代遅れの危機管理 パスワードなし”
共同の部隊
自衛隊サイバー防衛隊
陸上自衛隊
サイバー防護隊
中央警務隊
海上自衛隊
保全監査隊
航空自衛隊
システム監査隊
第2作戦システム隊
警察
警察組織全体
サイバーフォース
サイバーポリス
サイバー犯罪捜査官
警察庁
サイバー警察局
サイバー特別捜査部（関東管区警察局）
サイバーフォースセンター（サイバーテロ対策技術室）
インターネット・ホットラインセンター（業務委託機関）
都道府県警察
サイバー犯罪対策室
警視庁サイバー犯罪対策課
警視庁サイバー犯罪捜査官
総務省
サイバーセキュリティ統括官
地方公共団体情報システム機構
経済産業省
商務情報政策局サイバーセキュリティ課
省庁所管法人
総務省所管
情報通信研究機構情報通信セキュリティ研究センター
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