ゲノムワイド関連解析
[Wikipedia|▼Menu]
□記事を途中から表示しています
[最初から表示]

^ a b c d Wellcome Trust Case Control Consortium, Burton PR (June 2007). “Genome-wide association study of 14,000 cases of seven common diseases and 3,000 shared controls”. Nature 447 (7145): 661?78. Bibcode: 2007Natur.447..661B. doi:10.1038/nature05911. PMC 2719288. PMID 17554300. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2719288/. 
^ a b c d “Basic statistical analysis in genetic case-control studies”. Nature Protocols 6 (2): 121?33. (February 2011). doi:10.1038/nprot.2010.182. PMC 3154648. PMID 21293453. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3154648/. 
^ “PLINK: a tool set for whole-genome association and population-based linkage analyses”. American Journal of Human Genetics 81 (3): 559?75. (September 2007). doi:10.1086/519795. PMC 1950838. PMID 17701901. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC1950838/6 
^ “Genome-wide detection of intervals of genetic heterogeneity associated with complex traits”. Bioinformatics 31 (12): i240-9. (June 2015). doi:10.1093/bioinformatics/btv263. PMC 4559912. PMID 26072488. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4559912/. 
^ “MOBAS: identification of disease-associated protein subnetworks using modularity-based scoring”. EURASIP Journal on Bioinformatics & Systems Biology 2015 (1): 7. (December 2015). doi:10.1186/s13637-015-0025-6. PMC 5270451. PMID 28194175. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5270451/. 
^ “Assessing the Collective Disease Association of Multiple Genomic Loci”. Proceedings of the 6th ACM Conference on Bioinformatics, Computational Biology and Health Informatics. BCB '15. New York, NY, USA: ACM. (2015-01-01). pp. 376?385. doi:10.1145/2808719.2808758. ISBN 978-1-4503-3853-0 
^ “Genotype imputation for genome-wide association studies”. Nature Reviews Genetics 11 (7): 499?511. (July 2010). doi:10.1038/nrg2796. PMID 20517342. 
^ “Genotype imputation with thousands of genomes”. G3 1 (6): 457?70. (November 2011). doi:10.1534/g3.111.001198. PMC 3276165. PMID 22384356. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3276165/. 
^ “A unified approach to genotype imputation and haplotype-phase inference for large data sets of trios and unrelated individuals”. American Journal of Human Genetics 84 (2): 210?23. (February 2009). doi:10.1016/j.ajhg.2009.01.005. PMC 2668004. PMID 19200528. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2668004/. 
^ “MaCH: using sequence and genotype data to estimate haplotypes and unobserved genotypes”. Genetic Epidemiology 34 (8): 816?34. (December 2010). doi:10.1002/gepi.20533. PMC 3175618. PMID 21058334. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3175618/. 
^ “Genes mirror geography within Europe”. Nature 456 (7218): 98?101. (November 2008). Bibcode: 2008Natur.456...98N. doi:10.1038/nature07331. PMC 2735096. PMID 18758442. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2735096/. 
^ “Genes, behavior, and behavior genetics”. Wiley Interdisciplinary Reviews. Cognitive Science 8 (1-2): e1405. (January 2017). doi:10.1002/wcs.1405. PMID 27906529. 
^ “A novel computational biostatistics approach implies impaired dephosphorylation of growth factor receptors as associated with severity of autism”. Translational Psychiatry 4 (1): e354. (January 2014). doi:10.1038/tp.2013.124. PMC 3905234. PMID 24473445. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3905234/. 
^ “Guidelines for genome-wide association studies”. PLOS Genetics 8 (7): e1002812. (July 2012). doi:10.1371/journal.pgen.1002812. PMC 3390399. PMID 22792080. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3390399/. 
^ Smith SM, Douaud G, Chen W, Hanayik T, Alfaro-Almagro F, Sharp K, Elliott LT (2021). “An expanded set of genome-wide association studies of brain imaging phenotypes in UK Biobank.”. Nat Neurosci. doi:10.1038/s41593-021-00826-4. PMID 33875891. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/eutils/elink.fcgi?dbfrom=pubmed&tool=sumsearch.org/cite&retmode=ref&cmd=prlinks&id=33875891. 
^ “Fine mapping of five loci associated with low-density lipoprotein cholesterol detects variants that double the explained heritability”. PLOS Genetics 7 (7): e1002198. (July 2011). doi:10.1371/journal.pgen.1002198. PMC 3145627. PMID 21829380. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3145627/6 
^ “Potential etiologic and functional implications of genome-wide association loci for human diseases and traits”. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 106 (23): 9362?7. (June 2009). Bibcode: 2009PNAS..106.9362H. doi:10.1073/pnas.0903103106. PMC 2687147. PMID 19474294. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2687147/. 
^ “An open access database of genome-wide association results”. BMC Medical Genetics 10: 6. (January 2009). doi:10.1186/1471-2350-10-6. PMC 2639349. PMID 19161620. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2639349/. 
^ “Complement factor H variant increases the risk of age-related macular degeneration”. Science 308 (5720): 419?21. (April 2005). Bibcode: 2005Sci...308..419H. doi:10.1126/science.1110359. PMID 15761120. 
^ “Design and development of TT30, a novel C3d-targeted C3/C5 convertase inhibitor for treatment of human complement alternative pathway-mediated diseases”. Blood 118 (17): 4705?13. (October 2011). doi:10.1182/blood-2011-06-359646. PMC 3208285. PMID 21860027. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3208285/. 
^ "Largest ever study of genetics of common diseases published today" (Press release). Wellcome Trust Case Control Consortium. 6 June 2007. 2008年6月19日閲覧。
^ “Validating, augmenting and refining genome-wide association signals”. Nature Reviews Genetics 10 (5): 318?29. (May 2009). doi:10.1038/nrg2544. PMC 7877552. PMID 19373277. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7877552/. 
^“Gene discovery and polygenic prediction from a genome-wide association study of educational attainment in 1.1 million individuals”. Nature Genetics 50 (8): 1112?1121. (July 2018). doi:10.1038/s41588-018-0147-3. PMC 6393768. PMID 30038396. ⇒http://man.ac.uk/C0BbE7
^ Genome-wide Analysis of Insomnia (N=1,331,010) Identifies Novel Loci and Functional Pathways. (January 2018). doi:10.1101/2149736 
^ “C-reactive protein and coronary disease: is there a causal link?”. Circulation 120 (21): 2036?9. (November 2009). doi:10.1161/CIRCULATIONAHA.109.907212. PMID 19901186. 
^ “Case-control association mapping by proxy using family history of disease”. Nature Genetics 49 (3): 325?331. (March 2017). doi:10.1038/ng.3766. PMID 28092683. 
^ “The pursuit of genome-wide association studies: where are we now?”. Journal of Human Genetics 55 (4): 195?206. (April 2010). doi:10.1038/jhg.2010.19. PMID 20300123. 
^ a b “Personal genomes: The case of the missing heritability”. Nature 456 (7218): 18?21. (November 2008). doi:10.1038/456018a. PMID 18987709. 

外部リンク

omicX上の遺伝子型-表現型相互作用ソフトウェアツールおよびデータベース

ゲノムワイド関連研究の分析のための統計的方法[ビデオ講義シリーズ]

全ゲノム関連研究?国立ヒトゲノム研究所による

GWAS Central ?要約レベルの遺伝的関連の調査結果の中央データベース

Barrett (2010年7月18日). “ ⇒How to read a genome-wide association study”. Genomes Unzipped. 2021年8月4日閲覧。

ゲノムワイド関連研究のコンソーシアム(GWAS) ? Bennett SN、Caporaso、NEなどによる。

PLINK ?全ゲノム関連解析ツールセット

ENCODEスレッドエクスプローラーバリエーションの理解に対する機能情報の影響。ネイチャー(ジャーナル)










個人ゲノミクス(英語版)
データ収集

バイオバンク

生物学データベース(英語版)

分野概念

生物学的標本

非特定化(英語版)

ヒトの遺伝的変異(英語版)

遺伝的連鎖

一塩基多型

同祖性(英語版)

遺伝子疾患

アプリケーション

オーダメイド医療

予測医学(英語版)

遺伝疫学(英語版)

ゲノム薬理学

分析手法

全ゲノム配列決定(英語版)

ゲノムワイド関連解析

SNPアレイ(英語版)

遺伝子診断

主なプロジェクト

ヒトゲノム計画

国際 HapMap 計画

ジェノグラフィック・プロジェクト

1000人ゲノムプロジェクト

サムライDNAプロジェクト

ヒトゲノム多様性プロジェクト(英語版)

.mw-parser-output .asbox{position:relative;overflow:hidden}.mw-parser-output .asbox table{background:transparent}.mw-parser-output .asbox p{margin:0}.mw-parser-output .asbox p+p{margin-top:0.25em}.mw-parser-output .asbox{font-size:90%}.mw-parser-output .asbox-note{font-size:90%}.mw-parser-output .asbox .navbar{position:absolute;top:-0.90em;right:1em;display:none}

この項目は、生物学に関連した書きかけの項目です。この項目を加筆・訂正などしてくださる協力者を求めていますプロジェクト:生命科学Portal:生物学)。
.mw-parser-output .hlist ul,.mw-parser-output .hlist ol{padding-left:0}.mw-parser-output .hlist li,.mw-parser-output .hlist dd,.mw-parser-output .hlist dt{margin-right:0;display:inline-block;white-space:nowrap}.mw-parser-output .hlist dt:after,.mw-parser-output .hlist dd:after,.mw-parser-output .hlist li:after{white-space:normal}.mw-parser-output .hlist li:after,.mw-parser-output .hlist dd:after{content:" ・\a0 ";font-weight:bold}.mw-parser-output .hlist dt:after{content:": "}.mw-parser-output .hlist-pipe dd:after,.mw-parser-output .hlist-pipe li:after{content:" |\a0 ";font-weight:normal}.mw-parser-output .hlist-hyphen dd:after,.mw-parser-output .hlist-hyphen li:after{content:" -\a0 ";font-weight:normal}.mw-parser-output .hlist-comma dd:after,.mw-parser-output .hlist-comma li:after{content:"、";font-weight:normal}.mw-parser-output .hlist-slash dd:after,.mw-parser-output .hlist-slash li:after{content:" /\a0 ";font-weight:normal}.mw-parser-output .hlist dd:last-child:after,.mw-parser-output .hlist dt:last-child:after,.mw-parser-output .hlist li:last-child:after{content:none}.mw-parser-output .hlist dd dd:first-child:before,.mw-parser-output .hlist dd dt:first-child:before,.mw-parser-output .hlist dd li:first-child:before,.mw-parser-output .hlist dt dd:first-child:before,.mw-parser-output .hlist dt dt:first-child:before,.mw-parser-output .hlist dt li:first-child:before,.mw-parser-output .hlist li dd:first-child:before,.mw-parser-output .hlist li dt:first-child:before,.mw-parser-output .hlist li li:first-child:before{content:" (";font-weight:normal}.mw-parser-output .hlist dd dd:last-child:after,.mw-parser-output .hlist dd dt:last-child:after,.mw-parser-output .hlist dd li:last-child:after,.mw-parser-output .hlist dt dd:last-child:after,.mw-parser-output .hlist dt dt:last-child:after,.mw-parser-output .hlist dt li:last-child:after,.mw-parser-output .hlist li dd:last-child:after,.mw-parser-output .hlist li dt:last-child:after,.mw-parser-output .hlist li li:last-child:after{content:")\a0 ";font-weight:normal}.mw-parser-output .hlist ol{counter-reset:listitem}.mw-parser-output .hlist ol>li{counter-increment:listitem}.mw-parser-output .hlist ol>li:before{content:" "counter(listitem)" ";white-space:nowrap}.mw-parser-output .hlist dd ol>li:first-child:before,.mw-parser-output .hlist dt ol>li:first-child:before,.mw-parser-output .hlist li ol>li:first-child:before{content:" ("counter(listitem)" "}.mw-parser-output .navbar{display:inline;font-size:75%;font-weight:normal}.mw-parser-output .navbar-collapse{float:left;text-align:left}.mw-parser-output .navbar-boxtext{word-spacing:0}.mw-parser-output .navbar ul{display:inline-block;white-space:nowrap;line-height:inherit}.mw-parser-output .navbar-brackets::before{margin-right:-0.125em;content:"[ "}.mw-parser-output .navbar-brackets::after{margin-left:-0.125em;content:" ]"}.mw-parser-output .navbar li{word-spacing:-0.125em}.mw-parser-output .navbar-mini abbr{font-variant:small-caps;border-bottom:none;text-decoration:none;cursor:inherit}.mw-parser-output .navbar-ct-full{font-size:114%;margin:0 7em}.mw-parser-output .navbar-ct-mini{font-size:114%;margin:0 4em}.mw-parser-output .infobox .navbar{font-size:88%}.mw-parser-output .navbox .navbar{display:block;font-size:88%}.mw-parser-output .navbox-title .navbar{float:left;text-align:left;margin-right:0.5em}


次ページ
記事の検索
おまかせリスト
▼オプションを表示
ブックマーク登録
mixiチェック!
Twitterに投稿
オプション/リンク一覧
話題のニュース
列車運行情報
暇つぶしWikipedia

Size:59 KB
出典: フリー百科事典『ウィキペディア(Wikipedia)
担当:undef