2012年3月17日、リドリー・スコットは『プロメテウス』には未解決の謎が多くあり、これらは続編で解決されるだろうと述べた。彼は「もし我々が幸運なら第二部があるだろう。それはあなたたちがいくつかの未解決の疑問を許す」と語った[19][20]。続編が『エイリアン』の直接の前日譚になるかを尋ねられた脚本のデイモン・リンデロフは「我々がもし続編を作るのに充分に幸運ならば（中略）それはさらにオリジナルの『エイリアン』から離れた所に逸れるだろう」と述べた[21]。2012年6月、リンデロフは続編で回答するためにプロットを意図的に未解決とする一方で、続編の製作が保証されていないために彼とスコットは『プロメテウス』が単独で成り立つように何を回答すべきかを議論したと述べた[22]。スコットは続編ではショウが次の目的地に行き、「もしもそれが楽園ならば、楽園はあなたが想像するものになることができない。楽園は非常に不吉で不気味な響きを持っている」と述べた。リンデロフは彼の参加に疑問を投げかけ、「もし（スコットが）私の関与を希望する場合、それを断るのは難しいだろう。同時に私は（『プロメテウス』が）新鮮な声や新鮮なテイクや新鮮な考えから恩恵を受ける可能性があると感じる」と述べた[23]。またスコットは『プロメテウス』の続編と『エイリアン』の間のギャップを埋める更なる映画が必要だろうと語った[24]。

2012年8月1日時点でフォックスはスコット、ノオミ・ラパス、マイケル・ファスベンダーに続編を依頼し、またリンデロフが続投しなかった場合の新たな脚本家との交渉を行った。