第二次世界大戦当時、RNVRはもはや戦時の士官の登用ルートの主流になっており、兵士が加わることはなかった。彼らは正規海軍やRNRと区別するために金線が波型になった袖章を着用していたため、「ウェイビー・ネイビー」と呼ばれた。この袖章は、後に、正規の海軍士官と同じまっすぐなストライプとなり、カールの中に小さな「R」の入ったものに変更された。ただしこれは、2007年11月30日以降、名誉士官を除いて廃止された。
RNRの〈名目上の〉メンバーとして、シー・カデット・コー（Sea Cadet Corps）とRN CCF（Combined Cadet Force）の士官は従来のRNVRの「ウェイビー・ネイビー」の袖章を引き続き使用する。彼らは（同時に主流のRNRの士官任官辞令を受けていない限り）それぞれの部隊に任用（appointed）されているだけであり、任官（commissioned）は受けていない。
1938年から1957年まで、RNVRは自身の飛行部隊から、飛行機搭乗員も供給した。戦後の1947年になって、彼らの配属は対潜部隊と戦闘機部隊だけに限定された。1957年には、最新装備を操作するための訓練は予備員に期待すべきではないと判断され、航空部隊は供給先から外された。航空部隊は1980年、RNASヨービルトンで再結成された。 イギリスの海軍予備員制度は1958年に一本化され、RNRはずっと大きなRNVR組織と合体した。100年にわたる誇り高きサービスの後、プロの船員による独立した予備員制度としてのRNRは、存在を終えた。2003年には、近衛騎兵のパレード付きのRNVR（1903年創設）創設百周年祭（ロンドン）が、チャールズ3世（当時王太子）臨席のもと、RNRによって執り行われた。 最近の50年にわたる防衛計画（Defence Review）は矛盾したものだった。ある年は予備員を切り詰めたかと思うと次には拡大し、新しい任務を与えて、すぐに取り下げ、また再びその任務に就かせるといった具合だったのである。1990年に行われたイギリス軍の再編の際にはRNRは1,200名減員となり、HMSカルプ（ジブラルタル）、HMSウェセックス（サウサンプトン）、HMSグレアム（グラスゴー）を含む多くの訓練センターが閉鎖された。1998年の戦略防衛計画はこの方針を、RNRの冷戦時の機雷戦に関する役割を除外することで継続する一方、RNRのポストを350増やすことも決定した。再組織されたRNRは主に兵站と通信の分野において「艦隊に対してさらなる増援を提供するために、拡張された人材プールを用意する」ように組み立てられている。 この戦略方針は、第二次湾岸戦争までの間、機雷戦部門の兵員や潜水のスペシャリストたちを忘れられた存在とする結果をもたらした。イギリス海軍はそのときになって、なんらの現実のポストを持たない予備員のプールを持っていたことに気づいた。第一次世界大戦当時のイギリス海軍師団と同様、水上防備部門（Above Water Force Protection branch）が、「戦争勃発時に特段の任務が与えられていない海軍予備員から」編成された。専門要員の不足から、機雷戦や潜水任務の一部は最近になってRNRに戻された。今日では、多くの将兵が「フルタイム予備員」として、アフガニスタンや中東やバルカン半島やイギリス本国に動員され、イギリス海軍のいたるところで実戦任務についている。 海軍の作戦行動や配属においてRNRの士官・兵員の割合が増加したため、2007年7月1日、制服の特別な標識（士官の場合には袖章や肩章のカールの中の「R」、それ他の階級ではRNRを示す肩章）を付けなくて良いことになった。 1994年の「イギリス海軍補助サービス（仮訳。RNXS:Royal Navy Auxiliary Service 現在のRNRは14の組織と6つの付属組織を有している。
RNVRとの統合以後
RNR 組織
HMSスコティア（ロサイス）
テイ分隊（ダンディー）：正式にはHMSキャンパーダウン。
HMSカンブリア（サリー、ウェールズ）
トウ分隊（スウォンジ）
HMSダリアダ（グリーノック）
ゴヴァン分隊
HMSフライングフォックス（ブリストル）
HMSカライアピ（陸上施設）（ゲーツヘッド）
セレス分隊（リーズ）
HMSプレジデント（陸上施設）（ロンドン）
メドウェイ分隊（チャタム、ケント）
HMSイーグレット（陸上施設）（リヴァプール）
ミネイ（Menai）分隊（ランディドノ
HMSヴィヴィッド（陸上施設、1957年）（デヴォンポート）
HMSシャーウッド（ノッティンガム）
HMSキング・アルフレッド（ポーツマス）