※以下の第1回は「アニメーション神戸96'」、第2回は「アニメーション神戸97'」を指す。
神戸賞

第1回（株）サテライト
第2回幾原邦彦（監督）

外国作品賞

第1回トイ・ストーリー
第2回ウォレスとグルミット、危機一髪!

部門賞・デジタル技術部門

第1回オムニバス・ジャパン
第2回スタジオジブリ

部門賞・声優部門

第1回林原めぐみ
第2回椎名へきる

個人賞

第1回庵野秀明（監督）
第2回宮崎駿（監督）
第3回ワタナベシンイチ（監督）
第4回大地丙太郎（監督）
第5回沖浦啓之（監督）
第6回北久保弘之（監督）
第7回原恵一（監督）
第8回黒田洋介（脚本家）
第9回神山健治（監督）
第10回吉田健一（アニメーター）
第11回長�M博史（監督）
第12回今石洋之（監督）
第13回磯光雄（監督）
第14回加藤久仁生（監督）
第15回細田守（アニメーション映画監督）
第16回岡田麿里（脚本家）
第17回上松範康（音楽プロデューサー/作詞・作編曲家）
第18回水島努（監督）
第19回岸誠二（監督）
第20回水島精二（監督）

※第1・2回は「部門賞・演出部門」の名称で授与。
特別賞

第1回藤子・F・不二雄（漫画家）
第2回野沢雅子（声優）
第3回大塚康生（アニメータ?）
第4回小山高生（脚本家）
第5回斯波重治（音響監督）
第6回大河原邦男（メカニックデザイナー）
第7回丸山正雄（プロデューサー）
第8回松本零士（漫画家）
第9回渡辺繁（プロデューサー）
第10回九里一平（ゼネラルプロデューサー）
第11回グループ・タック（制作会社）
大山のぶ代・小原乃梨子・野村道子・肝付兼太・たてかべ和也（声優）
第12回高畑勲（監督）
第13回辻真先（作家・脚本家）
第14回雪室俊一（作家・脚本家）
第15回株式会社美峰（アニメーション背景美術）
第16回出�ｱ統（監督）
名探偵コナン製作チーム
第17回株式会社サンジゲン（3DCGアニメーション）
第18回河森正治（アニメ監督、メカデザイナー、ビジョンクリエイター）
プリキュアシリーズ製作チーム
第19回株式会社京都アニメーション（制作会社）
第20回安彦良和 (漫画家、アニメーター、アニメ監督)

※第1回は「読売賞」の名称で授与。
作品賞・劇場部門

第1回GHOST IN THE SHELL / 攻殻機動隊
第2回（劇場映画の部）もののけ姫
（会場特別賞）新世紀エヴァンゲリオン劇場版 シト新生
新世紀エヴァンゲリオン劇場版 Air/まごころを、君に
（神戸市民特別賞）地球が動いた日