オープニングはアニメーションで作られている。
主題歌「にこにこぷん」
作詞 - 井出隆夫 / 作曲・編曲 - 越部信義 / 歌 - じゃじゃまる、ぴっころ、ぽろりタイトルロゴは映像の最後に登場する。歌詞が追加されたフルバージョンもある。
放送開始当初
3人は登場せず、にこにこ島全体のみが映る映像だった。曲調も少し異なっていた。
2代目のオープニング
アニメーションで『おかあさんといっしょ』のオープニングと一体化していた。このスタイルは『ドレミファ・どーなっつ！』の1999年3月まで引き継がれていた。実写版では山が噴火するところでタイトルロゴ　『にこにこ、（改行）ぷん』に変化、一瞬ではあるがじゃじゃまる、ぴっころ、ぽろりの3人がロゴから現れワイプが拡大する形で実写に移る。アニメ版では3人が滑る虹が解体しつつタイトルロゴ『にこにこ、（改行）ぷん』を形成し、ブラックアウトからのフェードで本編に移る。また『おかあさん（改行）と（改行）いっしょ』のタイプのタイトルロゴがオープニングで使われていたのはこの作品が最後となる（エンディングでは『ぐ?チョコランタン』終了まで使用）。ちなみに実写版とアニメシリーズでは曲のテンポが異なっていた。『おかあさんといっしょ 40周年記念コンサート』では坂田おさむ、神崎ゆう子、速水けんたろう、茂森あゆみの4人がこの曲を歌唱した[注釈 14]。
挿入歌
全作詞：井出隆夫 / 全作曲・編曲：越部信義
じゃじゃまる
「おいら男だ」「菜の花畑で思い出す」「じゃじゃまる大漁節」「母待岬」「牛乳節」
ぴっころ
「かわいいぴっころちゃん」「炎の女の子」
ぽろり
「ぼくはかいぞく」（1982年4月6日放送）「ごめんねピーマン」（1991年1月10日放送）「風がひいてるバイオリン」
じゃじゃまる、ぴっころ
「ないってばない」（1982年4月5日放送）
ぴっころ、ぽろり
「なまムギ なまゴメ なまタマゴ」「女王さまがいっぱい」
3人
「シュビ・ドゥビ・パパヤ」(1992年6月19日放送)「キラキラ夏」「ピクニックマーチ」「あそべあそべ」「ぴょんぴょん カンガルー」「アイアイアイスクリーム」「ハヒフホ・カレー」「ドーナツどうして穴がある?」「ぴかぴかマーチ」「ママ・ムーチョ」「緑っていいね」「ともだちってなんだろな」「夕焼けはママのにおい」「おさんぽマーチ」「いつもとおんなじさようなら」（1992年10月3日放送）
じゃじゃまる、ぴっころ、ぽろり、かしの木おじさん
「にこにこ音頭」「のんびり・のびのび」「お日さまありがとう」「すくすく音頭」
ファミリーコンサート

公演タイトル出演者（一部を除く）
1988年にこにこぷん・じゃじゃまる印のイベント宅配便古今亭志ん輔、坂田おさむ、神崎ゆう子、馮智英、天野勝弘
じゃじゃまる、ぴっころ、ぽろり
1989年おかあさんといっしょ30年坂田おさむ、神崎ゆう子、馮智英、天野勝弘
じゃじゃまる、ぴっころ、ぽろり
眞理ヨシコ、中野慶子、竹前文子、砂川啓介
中川順子、片桐和子、瀬端優美子、斉藤昌子
森晴美、田中星児、斉藤伸子、松熊由紀
奈々瀬ひとみ、水木一郎、たいらいさお、宮内良
かしわ哲、林アキラ、しゅうさえこ
ブンブン、つね吉、ごじゃえもん
キャラクター・オン・ステージ坂田おさむ、神崎ゆう子、馮智英、天野勝弘
じゃじゃまる、ぴっころ、ぽろり
ゴロンタ、トムトム、チャムチャム
ブンブン、つね吉、ごじゃえもん
1990年母と子のファミリーコンサート坂田おさむ、神崎ゆう子、馮智英、天野勝弘
じゃじゃまる、ぴっころ、ぽろり
斉藤昌子、奈々瀬ひとみ、クニ河内、坂田めぐみ
げんき?元気古今亭志ん輔、坂田おさむ、神崎ゆう子、馮智英、天野勝弘
じゃじゃまる、ぴっころ、ぽろり
林アキラ、森みゆき
ゴロンタ、トムトム、チャムチャム
ブンブン、つね吉、ごじゃえもん