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近親交配(きんしんこうはい、英: inbreeding)とは、親縁係数が0でない個体同士を掛け合わせること。内系交配、インブリード、インブリーディングとも。同一個体で行われる場合は、自家受精(植物の場合は自家受粉)という。これは一般的には好ましくないものとされ、生物にはそれを避ける仕組みを持つものが様々な群で知られる。 有性生殖をする生物の多くは常染色体上の遺伝因子一つにつき二つの遺伝子を持っている。一方は父親から、もう一方は母親から受け継いだものである。どちらか片親からその遺伝子を受け継いだだけで形質に現れる遺伝子を優性の遺伝子、両親から同一の遺伝子をもらった場合のみにその形質が現れるのを劣性の遺伝子という。(ここでの優性、劣性とは「優れている」「劣っている」という意味ではない。) 例えばABO式血液型では、A型とB型の遺伝子が優性、O型の遺伝子が劣性である。一般的に血液型と言われる表現型のO型は両方の親からO型の遺伝子を受け継がなければ発現しない[注釈 1]。また耳垢は湿性が優性で乾性が劣性である。 遺伝子の中には耳垢のように生存に無関係のものが多いが、有利・不利をもたらすものもある。それらはそれぞれ優性(顕性)の場合もあれば劣性(潜性)の場合もある。生存に不利な遺伝子のうち、優性のものは高い頻度で発現する。そのような遺伝子を受け継いだ個体は生存と繁殖上不利であるから自然選択によって取り除かれる。一方、劣性遺伝かつ生存に不利な遺伝子は、片親から受け継いだだけでは発現しないため取り除かれにくい。そのため、現生生物
近親交配の危険性
個体について言えば、血縁関係の遠い個体との交配では生存に不利となる劣性遺伝子を両親ともに持っていることは少ない。しかし、両親が同じ生存に不利な遺伝子を持っている可能性が比較的高くなるため、その遺伝子が子に伝わり発現する可能性が比較的高まる。
実際の生物での近親交配