農学研究科（のうがくけんきゅうか、英称：The Graduate School of Agriculture）は、日本の大学院研究科のうち、農学の高度な教育研究を行う機構の1つである。
いずれも1953年に、国立は東北大学と京都大学が、私立は東京農業大学が初めて農学研究科の名称を冠した研究科を設置した。
一部の大学では、工学や理学分野とともに自然科学研究科・環境学研究科として開設されている。また、農学分野を専攻できる近接研究科としては生物資源科学研究科、生物資源学研究科などがある。 主に、農学部の上位に連続した形で設置され、博士前期課程（修士課程）および博士後期課程（博士課程）あるいはそれに相当する課程で構成される。学位は、修士課程は修士（農学）を、博士課程は博士（農学）を修めることができ、他は、それに相当する専攻名称等に応じた学位を修める。
概要
農学研究科を置く大学
国立
岩手大学大学院農学研究科（1964年度?）
山形大学大学院農学研究科（1970年度?）
東北大学大学院農学研究科（1953年度?）
宇都宮大学大学院農学研究科（1966年度?）
茨城大学大学院農学研究科（1970年度?）
京都大学大学院農学研究科（1953年度?）
神戸大学大学院農学研究科（1972年度?）
鳥取大学大学院農学研究科（1967年度?）
山口大学大学院農学研究科（1969年度?）
愛媛大学大学院農学研究科（1967年度?）
香川大学大学院農学研究科（1968年度?）
佐賀大学大学院農学研究科（1970年度?）
宮崎大学大学院農学研究科（1967年度?）
鹿児島大学大学院農学研究科（1966年度?）
琉球大学大学院農学研究科（1977年度?）
公立
大阪公立大学大学院農学研究科（2022年度?）
私立
東京農業大学大学院農学研究科（1953年度?）
明治大学大学院農学研究科（1959年度?）
玉川大学大学院農学研究科（1977年度?）
名城大学大学院農学研究科（1973年度?）
龍谷大学大学院農学研究科（2018年度?）
近畿大学大学院農学研究科（1985年度?）
東海大学大学院農学研究科（1984年度?）
（前身の九州東海大学 農学研究科から）
農学研究科と類似する研究科名称
弘前大学大学院 農学生命科学研究科（1971年度?）（前身の農学研究科から）
福島大学大学院 食農科学研究科（2023年度?）
東京大学大学院 農学生命科学研究科（1953年度?）（前身の生物系研究科から）
名古屋大学大学院 生命農学研究科（1969年度?）（前身の農学研究科から）
農学を専攻できる他の研究科名称
帯広畜産大学大学院 畜産学研究科
北里大学大学院 獣医畜産学研究科
酪農学園大学大学院 酪農学研究科
宮城大学大学院 食産業学研究科
千葉大学大学院 園芸学研究科
東京農業大学大学院 生物産業学研究科
東京農業大学大学院 国際食料農業科学研究科
東京農業大学大学院 地域環境科学研究科
日本獣医生命科学大学大学院 獣医生命科学研究科
中部大学大学院 応用生物学研究科
滋賀県立大学大学院 環境科学研究科
京都先端科学大学大学院 バイオ環境研究科
南九州大学大学院 園芸学・食品科学研究科