軍艦奉行(ぐんかんぶぎょう)は、江戸時代末期(幕末)に江戸幕府により設置された役職名の事である。
安政6年(1859年)に設置される。幕府海軍を統括し、軍艦の製造・購入や操錬技術者の育成などを管轄する。万延元年(1860年)には咸臨丸を出航させる。歴代永井尚志(1859年)水野忠徳(1859年)井上清直(1859年 - 1862年)木村喜毅(1859年 - 1863年、1867年 - 1868年)内田正徳(1862年 - 1863年)松平乗原